65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13361 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  100 
 
 		 389 aa  803    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  63.97 
 
 		 392 aa  535  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  64.43 
 
 		 390 aa  528  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  63.19 
 
 		 386 aa  505  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  65.27 
 
 		 389 aa  502  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  33.15 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  34.72 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  33.43 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  32.87 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  32.87 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  30.66 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  33.42 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  34.6 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  33.88 
 
 		 339 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  34.24 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  33.33 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  37.28 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  32.84 
 
 		 337 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  32.04 
 
 		 337 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  31.96 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  33.52 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  31.34 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  30.6 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  31.87 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  31.29 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  31.52 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  31.71 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  31.49 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  30.99 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  34.01 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  31.01 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  33.97 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  30.47 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  29.37 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  27.85 
 
 		 211 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  37.84 
 
 		 205 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  26.9 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  37.21 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1890  50S ribosomal protein L3  41.82 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  26.49 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1975  50S ribosomal protein L3  41.82 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1988  50S ribosomal protein L3  41.82 
 
 		 236 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  33.04 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  28.57 
 
 		 223 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  24.84 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  34.38 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  31.86 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  35.63 
 
 		 205 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  31.86 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  31.86 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  31.86 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  26.58 
 
 		 226 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  31.86 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  31.86 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  31.86 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  31.86 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 212 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 211 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  26.63 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  35.42 
 
 		 216 aa  43.5  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  35.63 
 
 		 210 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  32.99 
 
 		 205 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>