47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47947 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  100 
 
 		 501 aa  1040    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  39.22 
 
 		 441 aa  276  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.96374 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  39.44 
 
 		 492 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  35.87 
 
 		 489 aa  242  9e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86817  Ribosome assembly protein  38.04 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.189505 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  29.59 
 
 		 432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  28.04 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47485  chromatin assembly complex, subunit 3  24.87 
 
 		 429 aa  104  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884795  normal  0.485977 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  25.4 
 
 		 411 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  26.87 
 
 		 466 aa  90.5  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  23.05 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  23.77 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  24.29 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39580  predicted protein  21.72 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40760  subunit of histone acetyltransferase  20.91 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500001  normal  0.43958 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  22.81 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49403  predicted protein  27.92 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220793  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02300  structural molecule, putative  25.33 
 
 		 1433 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.781693  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  33.59 
 
 		 1133 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  22.73 
 
 		 485 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  25.42 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  23.91 
 
 		 402 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.66 
 
 		 1831 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  30.58 
 
 		 363 aa  53.5  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  27.51 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  24.84 
 
 		 1289 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46891  predicted protein  34.18 
 
 		 1007 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.861173  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27655  predicted protein  29.5 
 
 		 843 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80311  component of the COPII coat of ER-Golgi vesicles  26.05 
 
 		 1244 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.11 
 
 		 1901 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  26.72 
 
 		 567 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  22.12 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1373 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_006686  CND01460  vacuolar membrane protein, putative  25.75 
 
 		 1073 aa  47  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06257  Protein transport protein sec31 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZM3]  25.22 
 
 		 1282 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0130265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  24.28 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  31.91 
 
 		 592 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08701  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02410)  27.69 
 
 		 1462 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32 
 
 		 835 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_006686  CND03830  conserved hypothetical protein  22.07 
 
 		 343 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01695  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G08530)  24.07 
 
 		 609 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.416154  normal  0.0260007 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42874  predicted protein  23.48 
 
 		 572 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0187431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51666  polyadenylation factor I subunit 2  22 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00880  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 7 (Eurofung)  20.9 
 
 		 355 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  25 
 
 		 881 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  23.47 
 
 		 1077 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  39.39 
 
 		 1807 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>