More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26422 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  100 
 
 
769 aa  1582    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  55.65 
 
 
563 aa  553  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  52.5 
 
 
644 aa  519  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  48.16 
 
 
560 aa  468  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  43.12 
 
 
495 aa  386  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  43.12 
 
 
461 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34027  predicted protein  64.6 
 
 
267 aa  354  4e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0453701  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33568  predicted protein  63.49 
 
 
266 aa  290  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42747  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33533  predicted protein  35.54 
 
 
544 aa  272  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.175528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  31 
 
 
452 aa  184  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  27.37 
 
 
441 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  28.98 
 
 
482 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33915  predicted protein  72.73 
 
 
145 aa  171  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.892876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  29.29 
 
 
454 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  28.37 
 
 
445 aa  161  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  29.61 
 
 
429 aa  160  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  28.29 
 
 
1055 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  29.24 
 
 
452 aa  160  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  26.79 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  30.33 
 
 
1053 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  31.28 
 
 
1064 aa  154  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.79 
 
 
1065 aa  154  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  29.44 
 
 
470 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  29 
 
 
1065 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  29.53 
 
 
1065 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.34 
 
 
1380 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  24.91 
 
 
1373 aa  152  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.99 
 
 
1065 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.99 
 
 
1065 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  28.21 
 
 
460 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  28.54 
 
 
452 aa  151  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  28.99 
 
 
1065 aa  151  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  24.72 
 
 
1373 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.57 
 
 
1065 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  24.44 
 
 
1373 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  24.67 
 
 
1373 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  24.67 
 
 
1373 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  24.67 
 
 
1373 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  24.67 
 
 
1373 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  25.49 
 
 
459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.48 
 
 
1065 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.29 
 
 
445 aa  149  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.99 
 
 
1065 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  27.62 
 
 
455 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  28.63 
 
 
489 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  27.35 
 
 
462 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  29.52 
 
 
452 aa  143  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.14 
 
 
432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  28.01 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  29.16 
 
 
462 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  27.29 
 
 
464 aa  142  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  26.37 
 
 
452 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  27.01 
 
 
462 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  26.67 
 
 
454 aa  141  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  24.41 
 
 
448 aa  140  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  25.47 
 
 
1365 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  25.74 
 
 
458 aa  140  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  28.79 
 
 
462 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  27.02 
 
 
466 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  26.5 
 
 
484 aa  139  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  27.44 
 
 
461 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  27.29 
 
 
546 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  28.76 
 
 
463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  26.4 
 
 
447 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  28.45 
 
 
437 aa  138  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  26.52 
 
 
549 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42499  predicted protein  27.96 
 
 
395 aa  136  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.439591  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  26.26 
 
 
470 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  25.71 
 
 
446 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  26.12 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  29.18 
 
 
463 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  27.09 
 
 
448 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.64 
 
 
1006 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56580  Cytochrome P450 52A6 (CYPLIIA6) (Alkane-inducible P450-ALK3)  26.42 
 
 
515 aa  134  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.137821  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37142  Cytochrome P450 52A3 (CYPLIIA3) (Alkane-inducible P450-ALK1-A) (P450-CM1) (CYP52A3-A) (Cytochrome P-450ALK)  27.16 
 
 
424 aa  134  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  29.2 
 
 
457 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  26.59 
 
 
459 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  25.43 
 
 
1074 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  27.42 
 
 
462 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  27.25 
 
 
479 aa  133  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35590  n-alkane inducible cytochrome P- 450  26.47 
 
 
523 aa  132  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07131  cytochrome P450, putative (Eurofung)  25.11 
 
 
474 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal  0.0135505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  24.68 
 
 
444 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03917  cytochrome P450, putative (Eurofung)  27.19 
 
 
557 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  26.62 
 
 
459 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  27.9 
 
 
457 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  25.11 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56638  Cytochrome P450 52A12 (Alkane hydroxylase 1) (Alkane-inducible p450alk 1) (DH-ALK2)  26.12 
 
 
522 aa  130  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  26.23 
 
 
462 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  25.25 
 
 
466 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  26.61 
 
 
458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  25.17 
 
 
464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  27.27 
 
 
466 aa  129  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  27.86 
 
 
463 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  25.79 
 
 
1075 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  26.54 
 
 
439 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  26.86 
 
 
445 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  24.65 
 
 
467 aa  127  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  27.49 
 
 
478 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  26.56 
 
 
486 aa  127  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>