56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34027 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_34027  predicted protein  100 
 
 
267 aa  552  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0453701  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  64.6 
 
 
769 aa  354  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33568  predicted protein  55.06 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42747  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  49.43 
 
 
563 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  46.89 
 
 
644 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  44.07 
 
 
495 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  44.07 
 
 
461 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  41.9 
 
 
560 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33533  predicted protein  33.52 
 
 
544 aa  88.6  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.175528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  31.21 
 
 
1053 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  26.23 
 
 
1075 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  28.21 
 
 
1065 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  28.21 
 
 
1065 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.56 
 
 
1065 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.21 
 
 
1065 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.56 
 
 
1065 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.56 
 
 
1065 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.56 
 
 
1065 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  28.21 
 
 
1065 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  26.84 
 
 
1063 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.1 
 
 
1065 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  25 
 
 
455 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  26.26 
 
 
441 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  26.67 
 
 
445 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  29.3 
 
 
1059 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  25.95 
 
 
482 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  26.74 
 
 
448 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  24.31 
 
 
460 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  26.15 
 
 
452 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  25.53 
 
 
458 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47234  predicted protein  63.64 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  24.02 
 
 
1380 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  24.7 
 
 
429 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  27.92 
 
 
457 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  26.76 
 
 
437 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  23.85 
 
 
480 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  29.41 
 
 
466 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  23.5 
 
 
1373 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  25.19 
 
 
452 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  24.31 
 
 
462 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  23.78 
 
 
466 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  21.97 
 
 
444 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  22.95 
 
 
1373 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  26.15 
 
 
454 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  22.88 
 
 
459 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  27.5 
 
 
430 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  23.18 
 
 
459 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  22.95 
 
 
1373 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33915  predicted protein  90 
 
 
145 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.892876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  22.95 
 
 
1373 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  22.95 
 
 
1373 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  22.95 
 
 
1373 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  22.95 
 
 
1373 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  27.67 
 
 
1055 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  26.74 
 
 
470 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  25.88 
 
 
469 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>