61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33568 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33568  predicted protein  100 
 
 
266 aa  552  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42747  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  63.49 
 
 
769 aa  289  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34027  predicted protein  55.06 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0453701  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  57.24 
 
 
563 aa  175  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  50.98 
 
 
644 aa  162  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  42.95 
 
 
560 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  42.21 
 
 
495 aa  128  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  42.21 
 
 
461 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33533  predicted protein  33.76 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.175528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  23.49 
 
 
455 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  24.16 
 
 
482 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  24.16 
 
 
452 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  26.14 
 
 
1065 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  25.89 
 
 
470 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  26.14 
 
 
1065 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.57 
 
 
1065 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.14 
 
 
1065 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.57 
 
 
1065 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.57 
 
 
1065 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.57 
 
 
1065 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  25.57 
 
 
1065 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  25 
 
 
460 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.14 
 
 
1065 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  22.81 
 
 
462 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  24.17 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  21.85 
 
 
469 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  27.54 
 
 
1053 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  25.76 
 
 
445 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  24.56 
 
 
441 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  17.45 
 
 
599 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  21.05 
 
 
459 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  22.06 
 
 
444 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  25.68 
 
 
437 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  24.69 
 
 
457 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  23.89 
 
 
462 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  21.82 
 
 
464 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  22.7 
 
 
452 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  19.75 
 
 
462 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  20.51 
 
 
452 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  19.59 
 
 
470 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  22.22 
 
 
461 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47234  predicted protein  67.74 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  22.9 
 
 
466 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  27.08 
 
 
1380 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  24.66 
 
 
484 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  21.93 
 
 
462 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01310  Cytochrome P450, putative  23.94 
 
 
582 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6014  cytochrome P450  19.87 
 
 
476 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  21.09 
 
 
454 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  22.4 
 
 
464 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  27.08 
 
 
1373 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  24 
 
 
451 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  26.8 
 
 
452 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  26.74 
 
 
448 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  23.03 
 
 
458 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.39 
 
 
1373 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.39 
 
 
1373 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.39 
 
 
1373 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  26.39 
 
 
1373 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.39 
 
 
1373 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.39 
 
 
1373 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>