More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56580 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_56580  Cytochrome P450 52A6 (CYPLIIA6) (Alkane-inducible P450-ALK3)  100 
 
 
515 aa  1070    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.137821  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58031  Cytochrome P450 52A13 (Alkane hydroxylase 2) (Alkane-inducible p450alk 2) (DH-ALK2)  63.55 
 
 
516 aa  686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413796  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56638  Cytochrome P450 52A12 (Alkane hydroxylase 1) (Alkane-inducible p450alk 1) (DH-ALK2)  58.17 
 
 
522 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35590  n-alkane inducible cytochrome P- 450  57.31 
 
 
523 aa  570  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37142  Cytochrome P450 52A3 (CYPLIIA3) (Alkane-inducible P450-ALK1-A) (P450-CM1) (CYP52A3-A) (Cytochrome P-450ALK)  58.53 
 
 
424 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07131  cytochrome P450, putative (Eurofung)  49.01 
 
 
474 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal  0.0135505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06057  cytochrome P450, putative (Eurofung)  43.92 
 
 
517 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09384  cytochrome P450, putative (Eurofung)  42.27 
 
 
512 aa  362  6e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284157  normal  0.464861 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03917  cytochrome P450, putative (Eurofung)  39.8 
 
 
557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal  0.0550101 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10617  cytochrome P450, putative (Eurofung)  38.97 
 
 
519 aa  270  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08411  Cytochrome P450 monooxygenase (Eurofung)  31.09 
 
 
519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06321  cytochrome P450, putative (Eurofung)  34.16 
 
 
410 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.430678 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04570  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
575 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.65378  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  26.42 
 
 
769 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  28.77 
 
 
1065 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  27.44 
 
 
482 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.59 
 
 
1065 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.59 
 
 
1065 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  27.83 
 
 
1065 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.82 
 
 
1065 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.82 
 
 
1065 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.85 
 
 
1065 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  27.83 
 
 
1065 aa  127  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  27.62 
 
 
1065 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.75 
 
 
1006 aa  127  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  28.21 
 
 
452 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  28 
 
 
460 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  25.24 
 
 
560 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  24.94 
 
 
644 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  24.71 
 
 
563 aa  120  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  25.61 
 
 
466 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  30.03 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  25.11 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  27.55 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  28.4 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  24.43 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.36 
 
 
433 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  24.44 
 
 
454 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  26.35 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  25.83 
 
 
1096 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  26.03 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  27.52 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  24.7 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  25.81 
 
 
453 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  27.58 
 
 
463 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  25.82 
 
 
484 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  26.2 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  25.27 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  24.57 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  27.27 
 
 
453 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  36.07 
 
 
1074 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  25.14 
 
 
464 aa  110  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  24.82 
 
 
461 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  24.45 
 
 
1075 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  25.38 
 
 
461 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  25.06 
 
 
495 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  26.84 
 
 
441 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  26.2 
 
 
446 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  25.57 
 
 
470 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  23.76 
 
 
448 aa  108  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  25.62 
 
 
466 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  24.82 
 
 
452 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  24.48 
 
 
451 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  25.72 
 
 
457 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  27.21 
 
 
474 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  26.2 
 
 
1373 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  27.21 
 
 
474 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  26.63 
 
 
479 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  26.46 
 
 
470 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.2 
 
 
1373 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  25.24 
 
 
460 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  21.97 
 
 
459 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  24.48 
 
 
467 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.96 
 
 
1380 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  25.43 
 
 
462 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  23.57 
 
 
444 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  27.93 
 
 
1083 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  23.39 
 
 
462 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  25.37 
 
 
471 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  26.2 
 
 
1373 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  27.1 
 
 
486 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1689  cytochrome P450  23.4 
 
 
432 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163805  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  24.88 
 
 
462 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  25.95 
 
 
459 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  25 
 
 
445 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  27.64 
 
 
463 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.2 
 
 
1373 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.2 
 
 
1373 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.2 
 
 
1373 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.2 
 
 
1373 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  24.25 
 
 
447 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  27.54 
 
 
492 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  25.37 
 
 
471 aa  103  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  23.58 
 
 
546 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  25.76 
 
 
465 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3382  putative cytochrome  24.05 
 
 
487 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  27.33 
 
 
492 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  24.76 
 
 
432 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  25 
 
 
469 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  25.28 
 
 
461 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>