More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56638 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_56638  Cytochrome P450 52A12 (Alkane hydroxylase 1) (Alkane-inducible p450alk 1) (DH-ALK2)  100 
 
 		 522 aa  1090    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35590  n-alkane inducible cytochrome P- 450  66.8 
 
 		 523 aa  709    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56580  Cytochrome P450 52A6 (CYPLIIA6) (Alkane-inducible P450-ALK3)  58.17 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.137821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58031  Cytochrome P450 52A13 (Alkane hydroxylase 2) (Alkane-inducible p450alk 2) (DH-ALK2)  54.77 
 
 		 516 aa  585  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37142  Cytochrome P450 52A3 (CYPLIIA3) (Alkane-inducible P450-ALK1-A) (P450-CM1) (CYP52A3-A) (Cytochrome P-450ALK)  55.06 
 
 		 424 aa  500  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07131  cytochrome P450, putative (Eurofung)  47.28 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal  0.0135505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06057  cytochrome P450, putative (Eurofung)  43.7 
 
 		 517 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09384  cytochrome P450, putative (Eurofung)  41.02 
 
 		 512 aa  359  9e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284157  normal  0.464861 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03917  cytochrome P450, putative (Eurofung)  42.37 
 
 		 557 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal  0.0550101 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10617  cytochrome P450, putative (Eurofung)  36.91 
 
 		 519 aa  274  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08411  Cytochrome P450 monooxygenase (Eurofung)  31.78 
 
 		 519 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.796468 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06321  cytochrome P450, putative (Eurofung)  34.31 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.430678 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04570  conserved hypothetical protein  29.62 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.65378  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  26.29 
 
 		 644 aa  140  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  26.12 
 
 		 769 aa  130  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  26.34 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  27.36 
 
 		 441 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  25.81 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  26.24 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  25.99 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  27.01 
 
 		 1096 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  26.09 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  26.44 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  24.55 
 
 		 563 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  25.59 
 
 		 1065 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  25.23 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  24.11 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  27.13 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  25.73 
 
 		 447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  27.82 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  25.47 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  25.97 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  25.29 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.88 
 
 		 1065 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.88 
 
 		 1065 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.88 
 
 		 1065 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  26.29 
 
 		 1006 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  26.07 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  25.17 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  26.9 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  25.77 
 
 		 439 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.24 
 
 		 1065 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  27.45 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  25.24 
 
 		 1065 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  27.21 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  26.03 
 
 		 1065 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  25.42 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  25.42 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.24 
 
 		 1065 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.52 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  25.82 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  28.06 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  26.32 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  26.98 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  25.45 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  34.41 
 
 		 1074 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  24.5 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  26.2 
 
 		 1065 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.05 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  26.78 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  26.94 
 
 		 1055 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  26.54 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  25.44 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  27.2 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  25.48 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  25.34 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  26.39 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  35.08 
 
 		 1063 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  25.54 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  27.34 
 
 		 446 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  23.46 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  24.83 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  24.07 
 
 		 459 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  25.56 
 
 		 452 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  24.38 
 
 		 444 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  25.93 
 
 		 452 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  25.49 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  24.64 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  25.44 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  22.71 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  26.76 
 
 		 455 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  24.75 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  24.95 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  25.97 
 
 		 430 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  26.62 
 
 		 446 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  25.74 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  24.4 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  25.56 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  24.7 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09007  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.1 
 
 		 531 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00471163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  24.7 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  27.01 
 
 		 1053 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  23.73 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01884  cytochrome P450, putative (Eurofung)  32.42 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.602174  normal  0.575691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  24.2 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4063  cytochrome P450  24.58 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.457655 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  23.44 
 
 		 1373 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  25.2 
 
 		 1075 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  23.46 
 
 		 1373 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  23.44 
 
 		 1373 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>