51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1402 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  648    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.85 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.81 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.32 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 		 365 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.51 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  26.69 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0859  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.02 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.38 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.45 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.34 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.32 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 		 808 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  24.56 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.85 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 		 343 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.72 
 
 		 639 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  24.81 
 
 		 639 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25 
 
 		 591 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.37 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.2 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  36.84 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05370  phospholipase C, putative  23.08 
 
 		 529 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.44 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.13 
 
 		 837 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.51 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.75 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.86 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  23.81 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.53 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.86 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  28.72 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.13 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.13 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.33 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  24.35 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.42 
 
 		 231 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>