59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0859 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  100 
 
 		 450 aa  909    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  58.44 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  51.84 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  50.43 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  45.22 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  39.25 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  35.46 
 
 		 445 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  31.68 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  30.33 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1634  ATPase  52.56 
 
 		 94 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  33.33 
 
 		 976 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  29.46 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  36.71 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  32 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  42.42 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  43.06 
 
 		 176 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  36.62 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  39.73 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  41.33 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  35.44 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  27.89 
 
 		 461 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  42.31 
 
 		 562 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  29.76 
 
 		 251 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  36.11 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  27.19 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  35.42 
 
 		 368 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  31.82 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.9 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  33.66 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  36.59 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  38.57 
 
 		 556 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  24.78 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  37.35 
 
 		 533 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  30.56 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  30.1 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  25.66 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  31.94 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  36.49 
 
 		 695 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  34.72 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  25.58 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  25.58 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  25.58 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  25.58 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  26.55 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  33.33 
 
 		 252 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  28.68 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  28.86 
 
 		 591 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  32.94 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  32.88 
 
 		 588 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5347  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  31.76 
 
 		 214 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  25.47 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  28.57 
 
 		 545 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  31.18 
 
 		 585 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30.53 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  32.43 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  27.52 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21961  excinuclease ABC subunit A  28.47 
 
 		 980 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  35.06 
 
 		 378 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>