102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2176 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  41.92 
 
 		 3350 aa  848    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  39.61 
 
 		 2588 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.16 
 
 		 3602 aa  961    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.46 
 
 		 3040 aa  1169    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  47.33 
 
 		 2530 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.14 
 
 		 2545 aa  714    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  50.64 
 
 		 3862 aa  2507    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  47.95 
 
 		 3790 aa  1153    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  56.5 
 
 		 3796 aa  1470    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  100 
 
 		 3300 aa  6531    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  69.55 
 
 		 5981 aa  3478    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  40.4 
 
 		 2345 aa  619  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  46.1 
 
 		 1268 aa  592  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.67 
 
 		 2600 aa  587  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  47.07 
 
 		 1077 aa  564  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.87 
 
 		 3967 aa  452  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1746  hypothetical protein  51.79 
 
 		 683 aa  410  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0518263  hitchhiker  0.0000860028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  30.43 
 
 		 3131 aa  351  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  30.13 
 
 		 3141 aa  348  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  30.29 
 
 		 3144 aa  344  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.24 
 
 		 1730 aa  340  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  48.65 
 
 		 412 aa  310  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0519  hypothetical protein  45.93 
 
 		 640 aa  305  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.891503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  28 
 
 		 3004 aa  303  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.55 
 
 		 3020 aa  302  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0054  hypothetical protein  47.83 
 
 		 660 aa  301  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.369318  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.59 
 
 		 3079 aa  297  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0577  putative adhesin  48.01 
 
 		 599 aa  295  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  30.44 
 
 		 3301 aa  293  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  25.55 
 
 		 5212 aa  291  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  30 
 
 		 3159 aa  288  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.12 
 
 		 2782 aa  286  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  30.23 
 
 		 3147 aa  284  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  32.12 
 
 		 3165 aa  283  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  35.08 
 
 		 3322 aa  282  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.25 
 
 		 3028 aa  282  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  33.21 
 
 		 3526 aa  269  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  31.61 
 
 		 1998 aa  261  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  27.09 
 
 		 2984 aa  258  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.08 
 
 		 3128 aa  256  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.99 
 
 		 2670 aa  247  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1521  hypothetical protein  53.5 
 
 		 397 aa  246  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  30.42 
 
 		 3081 aa  240  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  30.28 
 
 		 3141 aa  238  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  30.17 
 
 		 3141 aa  236  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.59 
 
 		 3884 aa  224  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  32.69 
 
 		 6274 aa  208  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  36.59 
 
 		 857 aa  208  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  29.07 
 
 		 2758 aa  206  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  31.09 
 
 		 2904 aa  203  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  30.92 
 
 		 3563 aa  202  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  30.92 
 
 		 3443 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  29.49 
 
 		 2061 aa  196  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  32.52 
 
 		 710 aa  194  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  31.66 
 
 		 991 aa  193  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  30.85 
 
 		 3501 aa  192  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.18 
 
 		 3475 aa  191  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  30.71 
 
 		 3552 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  25.02 
 
 		 2651 aa  169  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  25.2 
 
 		 2732 aa  157  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.49 
 
 		 3480 aa  153  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  33.58 
 
 		 1038 aa  150  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4398  hypothetical protein  55.49 
 
 		 330 aa  143  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.32 
 
 		 3378 aa  143  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  26.77 
 
 		 2547 aa  142  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  26.58 
 
 		 4966 aa  142  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1052 aa  141  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  24.57 
 
 		 2542 aa  135  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  26.01 
 
 		 2827 aa  135  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  28.23 
 
 		 2964 aa  133  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  32.56 
 
 		 915 aa  128  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.8 
 
 		 3785 aa  127  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  27.19 
 
 		 1571 aa  120  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1625  hypothetical protein  55.45 
 
 		 351 aa  111  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  28.09 
 
 		 763 aa  111  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  30.14 
 
 		 980 aa  99  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  38.65 
 
 		 848 aa  88.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.85 
 
 		 1723 aa  82.8  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0058  putative hemagglutinin-related protein  36.48 
 
 		 361 aa  73.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  32.22 
 
 		 2536 aa  68.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0057  hypothetical protein  34.76 
 
 		 462 aa  67.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.59 
 
 		 1769 aa  65.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  24.09 
 
 		 2449 aa  61.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.1 
 
 		 2786 aa  61.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.57 
 
 		 2818 aa  60.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.24 
 
 		 1489 aa  58.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  31.25 
 
 		 2751 aa  57.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  24.84 
 
 		 2691 aa  57  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.66 
 
 		 2421 aa  56.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  25.88 
 
 		 812 aa  56.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0582  putative adhesin/hemolysin  31.62 
 
 		 265 aa  55.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.588513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  31.53 
 
 		 1035 aa  54.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  31.53 
 
 		 761 aa  54.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  30.2 
 
 		 2737 aa  53.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  21.09 
 
 		 1719 aa  52.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0286  hypothetical protein  25.07 
 
 		 780 aa  53.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000987796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1481  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1275 aa  52  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  23.61 
 
 		 1651 aa  51.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  23.68 
 
 		 1489 aa  50.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  20.44 
 
 		 1615 aa  48.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>