59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2923 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  100 
 
 
761 aa  1520    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  61.41 
 
 
1035 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  71.04 
 
 
2536 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  39.3 
 
 
3929 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4486  metalloendopeptidase  69.52 
 
 
306 aa  275  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.604115  normal  0.0822021 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.6 
 
 
2786 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.88 
 
 
2818 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.81 
 
 
2666 aa  239  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  36 
 
 
2691 aa  234  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0157  adhesin HecA  39.69 
 
 
2204 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  36.98 
 
 
2751 aa  207  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.99 
 
 
2847 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7339  adhesin HecA  35.69 
 
 
515 aa  99  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991029  normal  0.53872 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  36.21 
 
 
3322 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_003296  RS02096  hypothetical protein  45.71 
 
 
75 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0983188  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.94 
 
 
3028 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  33.33 
 
 
3081 aa  62  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.82 
 
 
3079 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.52 
 
 
3128 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.48 
 
 
2600 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  35.14 
 
 
2984 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.96 
 
 
3020 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  33.96 
 
 
3004 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.86 
 
 
2345 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  31.18 
 
 
3526 aa  56.6  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  26.7 
 
 
3443 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  26.7 
 
 
2904 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  26.7 
 
 
3563 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.37 
 
 
4966 aa  54.3  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  30.3 
 
 
3131 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  31.53 
 
 
3300 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.53 
 
 
5981 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  28.02 
 
 
991 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  33.03 
 
 
3501 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  30.41 
 
 
3144 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  32.56 
 
 
2547 aa  51.6  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  33.03 
 
 
3552 aa  51.6  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  32.08 
 
 
3301 aa  51.2  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  29.94 
 
 
3141 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.04 
 
 
6274 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  33.66 
 
 
5212 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  31.78 
 
 
2651 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.97 
 
 
3862 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  31.78 
 
 
2732 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.09 
 
 
2827 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.36 
 
 
3785 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  28.5 
 
 
980 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.65 
 
 
3602 aa  48.9  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  35 
 
 
1998 aa  48.5  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  31.3 
 
 
3159 aa  48.5  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  34 
 
 
2542 aa  48.5  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  36.46 
 
 
3165 aa  48.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.81 
 
 
2670 aa  47.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.89 
 
 
2782 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.33 
 
 
3475 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.33 
 
 
3480 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.33 
 
 
3378 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  28.46 
 
 
2964 aa  45.8  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.57 
 
 
3796 aa  45.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>