68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2928 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  100 
 
 
1035 aa  2069    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  75.05 
 
 
2536 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  53.48 
 
 
2737 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  41.89 
 
 
2786 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  59.56 
 
 
761 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  38.32 
 
 
3929 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  38.98 
 
 
2751 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  35.67 
 
 
2691 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.54 
 
 
2666 aa  337  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0157  adhesin HecA  37.3 
 
 
2204 aa  331  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.5 
 
 
2818 aa  300  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.07 
 
 
2847 aa  287  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4486  metalloendopeptidase  70.05 
 
 
306 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.604115  normal  0.0822021 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7338  adhesin  83.84 
 
 
99 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335427  normal  0.411737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  28.79 
 
 
980 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  30.55 
 
 
5212 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4398  hypothetical protein  51.9 
 
 
330 aa  83.2  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2785  hypothetical protein  32.47 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  30.24 
 
 
3322 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.82 
 
 
3028 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  30.86 
 
 
3081 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7339  adhesin HecA  28.74 
 
 
515 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991029  normal  0.53872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.64 
 
 
3079 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.38 
 
 
5981 aa  62.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02096  hypothetical protein  45.71 
 
 
75 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0983188  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.77 
 
 
3020 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  30.06 
 
 
3300 aa  62.4  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  29.6 
 
 
3526 aa  61.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.52 
 
 
3128 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  28.65 
 
 
6274 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  25.58 
 
 
3563 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  28.16 
 
 
3443 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  25.58 
 
 
2904 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.48 
 
 
2600 aa  59.7  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  28.39 
 
 
991 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.19 
 
 
2345 aa  58.9  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  30.9 
 
 
2984 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.84 
 
 
3040 aa  56.6  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30 
 
 
2827 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  28.32 
 
 
3131 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.06 
 
 
3785 aa  56.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  33.96 
 
 
3004 aa  56.2  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30 
 
 
3862 aa  55.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.53 
 
 
4966 aa  55.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  27.86 
 
 
3141 aa  54.7  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  28.32 
 
 
3144 aa  54.7  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  24.49 
 
 
2670 aa  55.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  29.03 
 
 
2547 aa  53.9  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  28.98 
 
 
3501 aa  53.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.53 
 
 
2421 aa  53.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  28.98 
 
 
3552 aa  53.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  25.26 
 
 
2651 aa  52.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  25.26 
 
 
2732 aa  52.4  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  32.08 
 
 
3301 aa  51.6  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.85 
 
 
3796 aa  51.2  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.63 
 
 
2782 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  29.3 
 
 
2542 aa  50.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.39 
 
 
3480 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.36 
 
 
3884 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.39 
 
 
3475 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.33 
 
 
3790 aa  49.7  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.39 
 
 
3378 aa  49.7  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.65 
 
 
3602 aa  48.9  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  33.94 
 
 
1998 aa  48.9  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  36.46 
 
 
3165 aa  48.5  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.17 
 
 
3967 aa  47.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  28.47 
 
 
2964 aa  47.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  28.88 
 
 
2530 aa  44.7  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>