29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4398 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4398  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  96.68 
 
 
3040 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  70.78 
 
 
1268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1625  hypothetical protein  66.67 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0577  putative adhesin  56.63 
 
 
599 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  73.08 
 
 
3602 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1746  hypothetical protein  56 
 
 
683 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0518263  hitchhiker  0.0000860028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  50.54 
 
 
3862 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  52.05 
 
 
2545 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  56 
 
 
2530 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  54.9 
 
 
2588 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  51.67 
 
 
1077 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  57.52 
 
 
3350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0519  hypothetical protein  59.06 
 
 
640 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.891503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  44.25 
 
 
2345 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.93 
 
 
3967 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0054  hypothetical protein  49.68 
 
 
660 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.369318  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2785  hypothetical protein  33.81 
 
 
278 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  55.49 
 
 
3300 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  51.6 
 
 
3796 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  44.81 
 
 
3790 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  51.9 
 
 
2691 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  45.86 
 
 
2600 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  51.9 
 
 
1035 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7338  adhesin  50.63 
 
 
99 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335427  normal  0.411737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  44.87 
 
 
5212 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  43.59 
 
 
980 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0058  putative hemagglutinin-related protein  33.11 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0057  hypothetical protein  32.45 
 
 
462 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>