64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0577 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  97.41 
 
 
3350 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  93.85 
 
 
1268 aa  776    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0519  hypothetical protein  98.69 
 
 
640 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.891503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  98.17 
 
 
1077 aa  721    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0577  putative adhesin  100 
 
 
599 aa  1192    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  98.9 
 
 
412 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1746  hypothetical protein  66.15 
 
 
683 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0518263  hitchhiker  0.0000860028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  65.98 
 
 
2545 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  65.98 
 
 
2588 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  66.15 
 
 
2530 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  58.8 
 
 
3040 aa  419  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  56.02 
 
 
3967 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  52.69 
 
 
3790 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  48.2 
 
 
2345 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0054  hypothetical protein  52.99 
 
 
660 aa  326  7e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.369318  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  55.01 
 
 
3602 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  45.86 
 
 
3862 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  45.78 
 
 
3796 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.48 
 
 
2600 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  48 
 
 
3300 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4398  hypothetical protein  56.63 
 
 
330 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1625  hypothetical protein  57.33 
 
 
351 aa  153  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1521  hypothetical protein  66.67 
 
 
397 aa  146  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.52 
 
 
5981 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.17 
 
 
2782 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  42.24 
 
 
3141 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  42.24 
 
 
3131 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  41.62 
 
 
3147 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  40.37 
 
 
3144 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  42.24 
 
 
3159 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  29.26 
 
 
763 aa  92  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.96 
 
 
3020 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  43.15 
 
 
3301 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  28.77 
 
 
1052 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  39.74 
 
 
2984 aa  87.8  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  38.1 
 
 
3165 aa  87  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  42.07 
 
 
3004 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  42.14 
 
 
1038 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.61 
 
 
3128 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  37.22 
 
 
3552 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  35.26 
 
 
3501 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.58 
 
 
3028 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  34.63 
 
 
1998 aa  82  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.26 
 
 
3079 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  34.07 
 
 
915 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.07 
 
 
3475 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  36.63 
 
 
3141 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.29 
 
 
3480 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.29 
 
 
3378 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.89 
 
 
2827 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4400  hypothetical protein  75.68 
 
 
69 aa  61.6  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  34.88 
 
 
3141 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  50 
 
 
710 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  29.19 
 
 
2061 aa  53.9  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  45.31 
 
 
3884 aa  53.9  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  47.62 
 
 
857 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0057  hypothetical protein  32.18 
 
 
462 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0058  putative hemagglutinin-related protein  35.81 
 
 
361 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  46.03 
 
 
3526 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0540  hypothetical protein  36.96 
 
 
153 aa  47.8  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.995335  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  41.67 
 
 
3322 aa  47.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  41.67 
 
 
848 aa  47.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2785  hypothetical protein  54.72 
 
 
278 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  25.99 
 
 
4966 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>