50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4486 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4486  metalloendopeptidase  100 
 
 		 306 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.604115  normal  0.0822021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  73.26 
 
 		 2536 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  70.05 
 
 		 1035 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  69.52 
 
 		 761 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  64.17 
 
 		 2737 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  50.27 
 
 		 3929 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0157  adhesin HecA  50.27 
 
 		 2204 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.85 
 
 		 2666 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.55 
 
 		 2847 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.39 
 
 		 2818 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  43.48 
 
 		 2786 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  42.65 
 
 		 2691 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  41.78 
 
 		 2751 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_003296  RS02096  hypothetical protein  48.57 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0983188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  31.85 
 
 		 3322 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.62 
 
 		 3128 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.71 
 
 		 2600 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.8 
 
 		 3020 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.29 
 
 		 2345 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  28.12 
 
 		 3526 aa  52.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.49 
 
 		 3480 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  26.11 
 
 		 2547 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  27.1 
 
 		 5212 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.81 
 
 		 3028 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  32.81 
 
 		 3004 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.24 
 
 		 3079 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.98 
 
 		 3378 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.98 
 
 		 3475 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  32.14 
 
 		 2984 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  25.15 
 
 		 3081 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  26.11 
 
 		 2651 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  26.11 
 
 		 2732 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  25.62 
 
 		 2542 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.3 
 
 		 2670 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  31.58 
 
 		 3563 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  31.58 
 
 		 2904 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  31.58 
 
 		 3443 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.5 
 
 		 3967 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  33.07 
 
 		 3501 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  29.69 
 
 		 3301 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  33.07 
 
 		 3552 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  31.37 
 
 		 980 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  32.52 
 
 		 991 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  26.53 
 
 		 2827 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  28.95 
 
 		 6274 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  34.71 
 
 		 3165 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.37 
 
 		 4966 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  30.43 
 
 		 2530 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  30.43 
 
 		 2588 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.43 
 
 		 2545 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>