More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0450 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  97.54 
 
 		 325 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 325 aa  664    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  86.11 
 
 		 325 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  83.64 
 
 		 325 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  74.77 
 
 		 325 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  73.12 
 
 		 322 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  72.5 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  72.81 
 
 		 322 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  72.5 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  72.5 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  71.52 
 
 		 326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  71.52 
 
 		 326 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  71.52 
 
 		 326 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  55.87 
 
 		 322 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  53.33 
 
 		 326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  51.93 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  52.25 
 
 		 317 aa  289  6e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  50.7 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  51.65 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  53.47 
 
 		 369 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  50.71 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  50.71 
 
 		 326 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  61.58 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  56.7 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  50.36 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  57.73 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  59.8 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  60.19 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  53.56 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  53.97 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  53.97 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  53.56 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  55.87 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  57.42 
 
 		 335 aa  241  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  63.98 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  51.28 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  54.82 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  56.74 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.21 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  48.16 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  43.75 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  47.23 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  49.79 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  46.9 
 
 		 410 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  46.38 
 
 		 418 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  48.23 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 		 412 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  48.23 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  48.23 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  47.35 
 
 		 404 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  47.79 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  47.79 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  46.02 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  48.65 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  44.93 
 
 		 404 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  46.46 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.58 
 
 		 410 aa  199  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  47.75 
 
 		 438 aa  199  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  46.46 
 
 		 429 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  48.68 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.49 
 
 		 411 aa  195  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.4 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  49.33 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 		 408 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  53.65 
 
 		 213 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.33 
 
 		 404 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  47.27 
 
 		 240 aa  189  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  47.16 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  42.42 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  47.14 
 
 		 403 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 		 414 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  43.17 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  45.53 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  44.75 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  41.41 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  45.85 
 
 		 405 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  45.49 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  51.36 
 
 		 234 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  45.85 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  44.83 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  45.04 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  46.43 
 
 		 279 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  43.48 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>