More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  100 
 
 
230 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  96.09 
 
 
230 aa  439  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  79.91 
 
 
241 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  80.09 
 
 
231 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  80.09 
 
 
231 aa  361  5e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  79.64 
 
 
231 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  77.48 
 
 
230 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  77.83 
 
 
231 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  76.92 
 
 
230 aa  354  8e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  74.24 
 
 
232 aa  332  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04383  two-component system regulatory protein  63.35 
 
 
226 aa  275  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  57.27 
 
 
244 aa  265  3e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  58.18 
 
 
244 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.46 
 
 
237 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 
232 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 
228 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 
228 aa  254  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  54.35 
 
 
232 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  55.65 
 
 
232 aa  251  9e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  55.65 
 
 
232 aa  251  9e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  54.82 
 
 
234 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  55.65 
 
 
234 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 
232 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 
232 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  55.65 
 
 
234 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  55.65 
 
 
234 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  55.65 
 
 
234 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  55.65 
 
 
234 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 
232 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 
232 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 
232 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 
232 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 
232 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  58.59 
 
 
230 aa  247  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  53.81 
 
 
231 aa  247  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 
232 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  56.11 
 
 
227 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 
231 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.15 
 
 
231 aa  239  3e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  51.34 
 
 
226 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.71 
 
 
231 aa  237  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.77 
 
 
231 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.20296e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 
235 aa  237  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  53.07 
 
 
230 aa  236  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.78 
 
 
229 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 
231 aa  235  5e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50 
 
 
226 aa  234  1e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.22 
 
 
229 aa  233  1e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 
236 aa  233  1e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.36 
 
 
230 aa  233  1e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  52.7 
 
 
234 aa  233  2e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 
225 aa  233  2e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 
225 aa  233  2e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 
232 aa  233  2e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 
233 aa  233  2e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.9 
 
 
225 aa  233  2e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.9 
 
 
225 aa  232  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  50.45 
 
 
225 aa  232  4e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  50.45 
 
 
225 aa  232  4e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.9 
 
 
225 aa  232  4e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
230 aa  232  4e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.45 
 
 
225 aa  231  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.45 
 
 
225 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.45 
 
 
225 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.45 
 
 
225 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50 
 
 
225 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 
231 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50 
 
 
225 aa  228  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50 
 
 
225 aa  228  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 
232 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 
235 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 
234 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 
234 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50 
 
 
225 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 
230 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 
230 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  51.49 
 
 
247 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
235 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
230 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  50 
 
 
229 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.34 
 
 
230 aa  221  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 
235 aa  220  1e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
230 aa  220  1e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  49.78 
 
 
231 aa  220  1e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  50.45 
 
 
228 aa  220  1e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 
248 aa  220  2e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  50.23 
 
 
226 aa  219  2e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 
226 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.24 
 
 
209 aa  219  4e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.24 
 
 
209 aa  219  4e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.24 
 
 
209 aa  219  4e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.03864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.58 
 
 
231 aa  218  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
240 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 
226 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 
226 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 
235 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 
226 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1514  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 
229 aa  216  3e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.23375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  52.04 
 
 
234 aa  216  3e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  48.44 
 
 
230 aa  216  3e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.21608e-14  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>