45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  95 
 
 
508 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  75.56 
 
 
480 aa  278  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  45.51 
 
 
554 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  41.18 
 
 
411 aa  120  1e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  37.85 
 
 
645 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  39.13 
 
 
681 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  36.88 
 
 
470 aa  108  4e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  36.53 
 
 
580 aa  107  7e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72597e-05 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  37.18 
 
 
777 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  34.78 
 
 
565 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  39.05 
 
 
463 aa  104  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  35.19 
 
 
478 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  35.19 
 
 
478 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  35.19 
 
 
478 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  35.19 
 
 
478 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  31.1 
 
 
458 aa  97.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
477 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
478 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
478 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  35.8 
 
 
604 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
460 aa  94.4  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  38.27 
 
 
409 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  37.33 
 
 
398 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  36.67 
 
 
397 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  38.27 
 
 
409 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  32.7 
 
 
485 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  24.39 
 
 
397 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  34.84 
 
 
397 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  34.84 
 
 
400 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  37.4 
 
 
541 aa  84  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  35.48 
 
 
398 aa  83.2  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  35.37 
 
 
572 aa  82.8  2e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  28.76 
 
 
453 aa  74.3  9e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  30.41 
 
 
436 aa  64.7  7e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  25.77 
 
 
453 aa  60.5  1e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  24.24 
 
 
438 aa  60.5  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  22.22 
 
 
424 aa  60.1  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  24.24 
 
 
438 aa  60.1  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  29.71 
 
 
433 aa  58.2  6e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  25.47 
 
 
406 aa  57  1e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  23.64 
 
 
409 aa  56.6  2e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  21.95 
 
 
503 aa  52  5e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  21.57 
 
 
495 aa  50.8  1e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  24.84 
 
 
406 aa  48.5  5e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>