More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01981 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  91.32 
 
 
242 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  90.08 
 
 
242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  90.5 
 
 
242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  76.13 
 
 
242 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  75.52 
 
 
242 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  73.44 
 
 
242 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  73.45 
 
 
245 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  73.01 
 
 
245 aa  348  5e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  74.78 
 
 
233 aa  345  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
235 aa  265  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  55.02 
 
 
231 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  55.46 
 
 
231 aa  259  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  54.87 
 
 
233 aa  254  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.95 
 
 
226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.51 
 
 
231 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.51 
 
 
231 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.56 
 
 
231 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 
216 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 
216 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 
223 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 
223 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
225 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 
212 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.67 
 
 
225 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  38.96 
 
 
227 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 
221 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 
217 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  36.68 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  33.9 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  41.35 
 
 
1418 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.59 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 
223 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  39.85 
 
 
257 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
204 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  33.18 
 
 
257 aa  109  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 
236 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.72 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  39.26 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.98 
 
 
227 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  38.03 
 
 
254 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  46.67 
 
 
228 aa  107  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  33.77 
 
 
248 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  39.1 
 
 
247 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 
225 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  37.76 
 
 
225 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  34.27 
 
 
254 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 
262 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  34.27 
 
 
254 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  39.85 
 
 
225 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 
227 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  37.32 
 
 
254 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 
259 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  41.61 
 
 
1172 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
229 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  37.32 
 
 
228 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  41.13 
 
 
268 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 
239 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  37.32 
 
 
254 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 
239 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 
247 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  39.86 
 
 
1156 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  41.73 
 
 
224 aa  105  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 
244 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 
246 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 
225 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 
243 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.12 
 
 
240 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  38.35 
 
 
247 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 
254 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 
243 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  41.61 
 
 
403 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
216 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  41.13 
 
 
258 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  40 
 
 
124 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.97 
 
 
225 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 
233 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  32.97 
 
 
230 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.59 
 
 
246 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.59 
 
 
246 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  35.17 
 
 
229 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
243 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
243 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.98 
 
 
228 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  29.2 
 
 
227 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  32.97 
 
 
234 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  32.29 
 
 
1388 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 
238 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  33.7 
 
 
233 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  33.15 
 
 
233 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  36.11 
 
 
1347 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  42.03 
 
 
232 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  32.42 
 
 
241 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  40 
 
 
242 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>