More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1422 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  58.92 
 
 		 192 aa  228  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  58.66 
 
 		 180 aa  224  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  54.89 
 
 		 182 aa  201  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  58.43 
 
 		 177 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  54.35 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  54.35 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  56.74 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  50.56 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  48.88 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  51.12 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  56.18 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  48.04 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  52.25 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  48.57 
 
 		 173 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  48.57 
 
 		 173 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  50.56 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  48.33 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  51.12 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  48.57 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  44.38 
 
 		 175 aa  158  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  47.25 
 
 		 187 aa  157  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  41.99 
 
 		 242 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  42.54 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  43.01 
 
 		 277 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  46.86 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  42.47 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  45.51 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  41.85 
 
 		 238 aa  154  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  40.54 
 
 		 266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  39.49 
 
 		 272 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  41.49 
 
 		 266 aa  150  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 306 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  40.53 
 
 		 280 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  40.1 
 
 		 267 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  41.24 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  39.09 
 
 		 266 aa  148  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  40 
 
 		 272 aa  148  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  45.6 
 
 		 177 aa  147  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  39.49 
 
 		 238 aa  147  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  47.98 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  41.9 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 250 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  45.41 
 
 		 262 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  45.14 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  48.65 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  38.27 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  38.27 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  38.27 
 
 		 271 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  44.2 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  41.36 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  38.19 
 
 		 276 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  40.64 
 
 		 246 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  37.63 
 
 		 269 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  40.66 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  42.02 
 
 		 273 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  39.29 
 
 		 299 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  42.7 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  41.49 
 
 		 301 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  42.7 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  42.13 
 
 		 177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  39.78 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  39.18 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  39.66 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  41.08 
 
 		 273 aa  136  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  39.01 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  39.01 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  39.9 
 
 		 296 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  40 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  39.44 
 
 		 243 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  41.8 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  42.25 
 
 		 255 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  37.24 
 
 		 317 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  38.76 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  37.36 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  36.52 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  40.31 
 
 		 320 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  38.83 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>