More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1026 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  65.95 
 
 
666 aa  865    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  67.13 
 
 
654 aa  906    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  66.98 
 
 
654 aa  905    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  67.14 
 
 
653 aa  887    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  67.13 
 
 
654 aa  906    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  67.13 
 
 
654 aa  906    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  67.13 
 
 
654 aa  906    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  54.86 
 
 
647 aa  700    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  67.13 
 
 
654 aa  906    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  54.5 
 
 
638 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  69.14 
 
 
656 aa  922    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  67.13 
 
 
654 aa  906    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53.64 
 
 
641 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  54.09 
 
 
637 aa  671    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  67.13 
 
 
654 aa  906    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  54.03 
 
 
642 aa  671    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  53.19 
 
 
645 aa  639    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  54.42 
 
 
643 aa  681    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  67.44 
 
 
654 aa  907    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  69.78 
 
 
645 aa  923    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  65.17 
 
 
663 aa  856    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  52.76 
 
 
640 aa  655    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  52.54 
 
 
644 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  67.29 
 
 
654 aa  894    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.5 
 
 
633 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  67.3 
 
 
644 aa  882    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
674 aa  1373    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  68.66 
 
 
661 aa  922    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  73.99 
 
 
687 aa  959    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  68.74 
 
 
649 aa  888    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  65.02 
 
 
665 aa  857    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  55.21 
 
 
644 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  67.29 
 
 
654 aa  895    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  70.69 
 
 
674 aa  956    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.84 
 
 
638 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  55 
 
 
638 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  51.75 
 
 
628 aa  632  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  52.84 
 
 
642 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.87 
 
 
647 aa  631  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  54.4 
 
 
640 aa  628  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  52.22 
 
 
637 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  51.24 
 
 
650 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  50.92 
 
 
649 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  52.2 
 
 
648 aa  627  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  54.59 
 
 
633 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  52.56 
 
 
648 aa  622  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  53.49 
 
 
634 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  53.48 
 
 
640 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  51.43 
 
 
632 aa  621  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  53.82 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  52.13 
 
 
633 aa  620  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 
640 aa  617  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  53.38 
 
 
637 aa  615  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  53.82 
 
 
640 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  52.37 
 
 
640 aa  617  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 
640 aa  617  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  53.77 
 
 
640 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  52.69 
 
 
642 aa  611  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  50.47 
 
 
636 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 
635 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  51.88 
 
 
650 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  50.47 
 
 
636 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  51.63 
 
 
651 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 
650 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.68 
 
 
642 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  52.28 
 
 
636 aa  599  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  50.47 
 
 
652 aa  599  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  49.04 
 
 
636 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 
644 aa  598  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.04 
 
 
649 aa  597  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  50.24 
 
 
637 aa  592  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  52.72 
 
 
642 aa  594  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  51.81 
 
 
643 aa  592  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  48.6 
 
 
644 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  48.43 
 
 
637 aa  591  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  50.55 
 
 
642 aa  588  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  49.07 
 
 
643 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  52.47 
 
 
635 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  50.16 
 
 
633 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  46.08 
 
 
686 aa  588  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.98 
 
 
638 aa  588  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  49.07 
 
 
642 aa  588  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  51.25 
 
 
672 aa  586  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  50.4 
 
 
642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  48.76 
 
 
649 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 
645 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  48.19 
 
 
660 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  51.09 
 
 
655 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  50.4 
 
 
642 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 
647 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  50.16 
 
 
635 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  51.88 
 
 
640 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  47.29 
 
 
675 aa  578  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  49.3 
 
 
643 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>