More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0076 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0076  arabinose efflux permease  100 
 
 
387 aa  754    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0049  arabinose efflux permease  44.79 
 
 
395 aa  332  8e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0075  arabinose efflux permease  44.53 
 
 
397 aa  330  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.761215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  37.34 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  36.15 
 
 
386 aa  245  8e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1794  major facilitator transporter  36.86 
 
 
386 aa  233  5e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  33.15 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  34.25 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  33.43 
 
 
415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  32.87 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  33.98 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  33.98 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  33.98 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  33.98 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  33.98 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  32.6 
 
 
404 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  32.85 
 
 
394 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1251  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
399 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1186  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.790878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.32 
 
 
391 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
404 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  29.03 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  29.64 
 
 
408 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  31.03 
 
 
391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  27.04 
 
 
405 aa  166  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  30.08 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  32.23 
 
 
391 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2289  transporter, putative  31.52 
 
 
391 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00964555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  29.09 
 
 
396 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  28.36 
 
 
388 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  28.57 
 
 
406 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  28.73 
 
 
391 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  28.73 
 
 
391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
388 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  28.73 
 
 
391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  28.73 
 
 
391 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  28.73 
 
 
391 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  26.61 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  27.7 
 
 
391 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  30.11 
 
 
390 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  27.99 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  27.99 
 
 
391 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
390 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  27.76 
 
 
391 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  27.41 
 
 
391 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  28.22 
 
 
398 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  26.9 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  27.99 
 
 
391 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  27.99 
 
 
416 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  26.9 
 
 
390 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  27.19 
 
 
390 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  28.37 
 
 
391 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.6 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  30.88 
 
 
387 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  29.43 
 
 
395 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  28.53 
 
 
400 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  27.42 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
392 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  28.53 
 
 
400 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  28.53 
 
 
400 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  27.81 
 
 
392 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  26.1 
 
 
385 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  27 
 
 
400 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
393 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  27.76 
 
 
388 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  24.86 
 
 
403 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  28.33 
 
 
391 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  27.76 
 
 
388 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
388 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
391 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  29.03 
 
 
414 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
386 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  28.25 
 
 
400 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  27.17 
 
 
397 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  30.8 
 
 
382 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  27.68 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  31.12 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  28.57 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  27.71 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  27.3 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  31.4 
 
 
388 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  27.3 
 
 
390 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  31.78 
 
 
388 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3237  transporter of the MFS superfamily  27.62 
 
 
380 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
402 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  27.51 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  29.23 
 
 
400 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>