42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2894 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  327  6e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  76.92 
 
 		 150 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  51.08 
 
 		 150 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  54.92 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  53.66 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  45.51 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  49.24 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  48.2 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  37.4 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  36 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  36.07 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  34.72 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  35.82 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  31.5 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  30.3 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  34.15 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  28.8 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  28 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  27.1 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  29.91 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  31.45 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  27.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  26.83 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  27.44 
 
 		 251 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  23.97 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  24.5 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  26.19 
 
 		 270 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  27.81 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  25.41 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  28.05 
 
 		 256 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  28.1 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  30.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  24.39 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  24.19 
 
 		 114 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  27.59 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  24.64 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  26.81 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  24.39 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  27.56 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  23.2 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  26.77 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>