More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0048 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  89.54 
 
 
240 aa  439  1e-122  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  76.15 
 
 
240 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  76.05 
 
 
241 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  74.9 
 
 
257 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  76.57 
 
 
240 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  76 
 
 
240 aa  358  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  58.09 
 
 
245 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  58.97 
 
 
248 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  60.59 
 
 
255 aa  271  5e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  56.36 
 
 
248 aa  266  3e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  56.3 
 
 
248 aa  265  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  57.14 
 
 
250 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  54.89 
 
 
250 aa  262  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  56.17 
 
 
248 aa  262  5e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  55.07 
 
 
236 aa  252  4e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  52.34 
 
 
241 aa  251  5e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  54.89 
 
 
252 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  53.51 
 
 
253 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  52.12 
 
 
239 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  52.16 
 
 
232 aa  219  2e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  49.57 
 
 
239 aa  220  2e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  49.79 
 
 
243 aa  216  3e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  48.26 
 
 
237 aa  215  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  49.15 
 
 
239 aa  214  1e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  48.25 
 
 
240 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  47.98 
 
 
243 aa  205  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  45.11 
 
 
243 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  44.92 
 
 
243 aa  200  1e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  46.98 
 
 
252 aa  195  5e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  44.63 
 
 
252 aa  195  5e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  45.45 
 
 
237 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  44.74 
 
 
227 aa  168  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  40.18 
 
 
223 aa  140  2e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.5 
 
 
219 aa  135  7e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  35.5 
 
 
219 aa  134  1e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  38.5 
 
 
223 aa  134  2e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  37.83 
 
 
223 aa  133  2e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  38.6 
 
 
221 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  37.83 
 
 
223 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  36.05 
 
 
226 aa  131  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  39.47 
 
 
221 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
223 aa  131  1e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  37.45 
 
 
221 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  40.36 
 
 
222 aa  128  7e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  38.94 
 
 
226 aa  125  4e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
229 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  36.52 
 
 
244 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  38.2 
 
 
229 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  35.44 
 
 
223 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 
223 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  32.31 
 
 
220 aa  120  1e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  34.75 
 
 
230 aa  121  1e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 
226 aa  119  5e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  37.02 
 
 
222 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  37.87 
 
 
221 aa  117  1e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  34.87 
 
 
226 aa  117  2e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  31.62 
 
 
220 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  37.71 
 
 
222 aa  114  1e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  31.62 
 
 
220 aa  114  1e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
232 aa  114  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  36.05 
 
 
221 aa  113  2e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  34.63 
 
 
225 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 
229 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  32.92 
 
 
232 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  34.63 
 
 
225 aa  111  1e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  35 
 
 
225 aa  111  1e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  33.05 
 
 
232 aa  110  2e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
225 aa  110  2e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
225 aa  110  2e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
228 aa  110  2e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
229 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  33.74 
 
 
222 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
232 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  35.81 
 
 
224 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  36.24 
 
 
224 aa  108  8e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  34.36 
 
 
319 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
228 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  34.31 
 
 
240 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
222 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  32.46 
 
 
239 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.45528e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  31.28 
 
 
249 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  35.65 
 
 
315 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  35.43 
 
 
230 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
223 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  35.78 
 
 
391 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
310 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 
222 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 
240 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
240 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  32.14 
 
 
324 aa  99.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  35.96 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  32.61 
 
 
320 aa  95.5  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  31.33 
 
 
240 aa  95.1  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  29.22 
 
 
411 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
236 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>