110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1971 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
84 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  38.27 
 
 
88 aa  55.5  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
96 aa  53.5  1e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  37.18 
 
 
178 aa  53.5  1e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  41.25 
 
 
114 aa  52.4  2e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 
89 aa  51.6  3e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  26.32 
 
 
189 aa  52  3e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.31673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  35.44 
 
 
196 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  35.44 
 
 
196 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
196 aa  50.1  9e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
196 aa  50.1  9e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  36.11 
 
 
196 aa  50.1  1e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
196 aa  49.7  1e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 
107 aa  49.3  2e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 
102 aa  48.9  2e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1317  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 
95 aa  49.7  2e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00152206  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 
186 aa  48.5  3e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 
92 aa  48.5  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.12129e-05 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 
94 aa  48.5  3e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 
186 aa  48.5  3e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  41.1 
 
 
92 aa  48.5  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
96 aa  48.5  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  34.62 
 
 
85 aa  48.1  4e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  34.18 
 
 
196 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 
99 aa  48.1  4e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  38.18 
 
 
99 aa  48.1  4e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
197 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 
85 aa  47.8  5e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  47.4  6e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  31.65 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  43.64 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  30.77 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  58.82 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.50484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  39.47 
 
 
184 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  58.82 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  2.19253e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.45532e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.0243e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.91839e-05  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  29.49 
 
 
197 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  34.72 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  8.25612e-07  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  34.72 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  35.9 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  33.8 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  42.31 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  28.95 
 
 
196 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  39.19 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 
199 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  58.82 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  58.82 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  30.26 
 
 
184 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  30.26 
 
 
184 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  40 
 
 
185 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  34.18 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  36 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  36.84 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  34.72 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.65213e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  34.88 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  37.1 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  32 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  30.43 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  2.51444e-08 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  35.85 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  45.61 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  30.67 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  55.26 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  38 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  39.06 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2437  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  55.26 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.26882e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  37.84 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  36.11 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  39.02 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  53.33 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  36.92 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  47.62 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  34.62 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  35.71 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.61919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  57.14 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>