More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0320 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  100 
 
 		 68 aa  135  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  79.37 
 
 		 65 aa  98.6  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  75.81 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.97 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 68 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  66.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  66.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  73.77 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  66.67 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  66.67 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  66.67 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 65 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  66.67 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  66.67 
 
 		 65 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  66.67 
 
 		 65 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  66.67 
 
 		 65 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  62.12 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  62.12 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  62.12 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  63.64 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 67 aa  93.2  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  67.69 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0367  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.12569e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  69.23 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  66.67 
 
 		 65 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  62.12 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  62.12 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  64.52 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  66.13 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0201  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.12 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.766684  hitchhiker  0.00947065 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  65.62 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 65 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 66 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  68.18 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 65 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 70 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 68 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2863  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  63.93 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  67.69 
 
 		 66 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>