More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0011 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 
365 aa  741  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  49.87 
 
 
383 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  47.41 
 
 
393 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  51.27 
 
 
361 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  48.2 
 
 
361 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  46.38 
 
 
376 aa  348  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  48.6 
 
 
362 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  47.4 
 
 
370 aa  346  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  47.96 
 
 
362 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  49.16 
 
 
364 aa  343  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.43922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  44.16 
 
 
371 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  47.44 
 
 
376 aa  340  3e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  48.61 
 
 
361 aa  337  2e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  47.51 
 
 
351 aa  336  3e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  46.11 
 
 
366 aa  336  3e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  48.06 
 
 
361 aa  337  3e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  48.06 
 
 
361 aa  336  4e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  47.24 
 
 
351 aa  336  4e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  46.22 
 
 
367 aa  335  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  48.33 
 
 
361 aa  335  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  48.9 
 
 
361 aa  335  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  48.9 
 
 
361 aa  335  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  48.63 
 
 
361 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  45.28 
 
 
366 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  47.96 
 
 
367 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  47.14 
 
 
362 aa  332  7e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  47.11 
 
 
364 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  48.75 
 
 
359 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  44.9 
 
 
367 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  46.11 
 
 
351 aa  320  2e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  46.47 
 
 
366 aa  320  4e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  45.88 
 
 
352 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  46.7 
 
 
343 aa  316  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  45.4 
 
 
364 aa  315  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  45.13 
 
 
364 aa  314  2e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  45.13 
 
 
364 aa  314  2e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  45.13 
 
 
364 aa  314  2e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  45.13 
 
 
364 aa  314  2e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  45.13 
 
 
364 aa  314  2e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  45.13 
 
 
364 aa  314  2e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  45.13 
 
 
364 aa  314  2e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  44.29 
 
 
366 aa  313  3e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  43.48 
 
 
364 aa  313  4e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  43.48 
 
 
364 aa  312  5e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  43.21 
 
 
364 aa  312  7e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  43.21 
 
 
364 aa  312  7e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  43.21 
 
 
364 aa  312  7e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  42.86 
 
 
364 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  44.69 
 
 
357 aa  308  8e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  43.92 
 
 
356 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  43.92 
 
 
356 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  45.07 
 
 
353 aa  306  4e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  43.87 
 
 
369 aa  306  5e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  42.01 
 
 
360 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  45.63 
 
 
351 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  43.84 
 
 
375 aa  300  2e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  45.76 
 
 
339 aa  300  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  42.15 
 
 
358 aa  298  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  44.03 
 
 
362 aa  298  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  42.02 
 
 
360 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  44.41 
 
 
355 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  45.22 
 
 
349 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  43.21 
 
 
363 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  42.49 
 
 
363 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  41.8 
 
 
372 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 
360 aa  288  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  43.53 
 
 
389 aa  286  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.38 
 
 
363 aa  285  1e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  42.58 
 
 
376 aa  284  2e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  38.72 
 
 
360 aa  282  7e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  40.16 
 
 
377 aa  282  7e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  43.18 
 
 
353 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  41.92 
 
 
373 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  43.7 
 
 
382 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  40.11 
 
 
363 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  40.05 
 
 
394 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  42.86 
 
 
365 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  42.62 
 
 
386 aa  279  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  39.79 
 
 
383 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  43.23 
 
 
348 aa  278  9e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  41.03 
 
 
376 aa  278  9e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  41.67 
 
 
368 aa  277  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  42.09 
 
 
382 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.96375e-10 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  37.78 
 
 
384 aa  275  1e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  41.08 
 
 
400 aa  274  1e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  43.73 
 
 
347 aa  274  2e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  41.74 
 
 
348 aa  273  4e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  40.39 
 
 
357 aa  273  4e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  40.96 
 
 
348 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  40.27 
 
 
368 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 
371 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  42.78 
 
 
369 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  38.86 
 
 
371 aa  270  3e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  38.86 
 
 
371 aa  270  3e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  38.86 
 
 
371 aa  270  3e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  39.57 
 
 
367 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  38.96 
 
 
367 aa  269  6e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  40.46 
 
 
350 aa  268  9e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  38.78 
 
 
358 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  42.98 
 
 
348 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>