More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4832 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  100 
 
 
311 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  51.52 
 
 
309 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  46.3 
 
 
301 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.04 
 
 
298 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  37.26 
 
 
318 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  37.22 
 
 
318 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  37.22 
 
 
318 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  37.22 
 
 
318 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.33 
 
 
302 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  40.19 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  42.86 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  36.62 
 
 
318 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  39.39 
 
 
318 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  36.28 
 
 
318 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  41.48 
 
 
304 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  39.58 
 
 
309 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  36.31 
 
 
318 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  41.3 
 
 
309 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  38.36 
 
 
317 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  44.41 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  38.85 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  38.85 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  38.22 
 
 
309 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  38.05 
 
 
317 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  43.82 
 
 
283 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  37.46 
 
 
306 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  41.33 
 
 
318 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  41.33 
 
 
318 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  41.33 
 
 
318 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  41.37 
 
 
301 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  37.03 
 
 
300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  41.87 
 
 
296 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  34.08 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.12 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  33.97 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.06 
 
 
333 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  45 
 
 
143 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  29.6 
 
 
349 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  29.29 
 
 
349 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32 
 
 
332 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  25.87 
 
 
321 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  35.04 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  28.93 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  31.15 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 
318 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  27.87 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  30.08 
 
 
340 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  30.08 
 
 
340 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.08 
 
 
340 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 
343 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  27.25 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  27 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.05 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.58 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  32.81 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.92 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.24 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  28.47 
 
 
340 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  27.52 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.73 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.08 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  35.16 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  24.53 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  24.53 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  24.53 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.56 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.26 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  33.19 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.96 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  29.8 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.58 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  30.84 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  31.93 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  31.19 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  31.19 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.38 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  25.82 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  31.18 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  31.18 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  31.18 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  31.19 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  26.81 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.51 
 
 
350 aa  79  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
345 aa  79  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  30 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  31.51 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  27.5 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.07 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  31.64 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.6 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  30.7 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>