More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0813 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  100 
 
 		 360 aa  716    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  36.18 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  36.47 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  32.83 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.89 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  34.08 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  35.44 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  35.32 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  31.89 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  31.79 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  32.19 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.17 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  30.97 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  29.85 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  34.47 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 		 349 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.98 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  27.13 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  27.13 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  32.38 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  27.13 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  31.5 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.47 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  34.5 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.06 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  28.06 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  28.06 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  28.92 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  28.92 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  28.92 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.49 
 
 		 318 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.3 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  26.88 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  30.49 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.84 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.84 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.84 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.55 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  29.17 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.89 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.81 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  27.6 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.17 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  27.6 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  27.6 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.75 
 
 		 348 aa  99.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  33.94 
 
 		 283 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  27.59 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  29.82 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  26.71 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  27.16 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  30.61 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.32 
 
 		 352 aa  96.3  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.26 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  28.81 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  29.39 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.18 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  28.72 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  31.6 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  32.48 
 
 		 309 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  28.09 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  27.43 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  27.43 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.13 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  28.92 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  28.42 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.13 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  31.37 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.69 
 
 		 328 aa  90.1  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.07 
 
 		 320 aa  90.1  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.15 
 
 		 333 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.34 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  30.69 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  30.63 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  30.69 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  31.1 
 
 		 304 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  30.69 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  30.2 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  29.6 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.9 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.7 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  28.35 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  28.72 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  30.87 
 
 		 304 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  30.38 
 
 		 314 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  26.74 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>