More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0807 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0807  ABC transporter related  100 
 
 		 497 aa  983    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3343  ABC transporter related  39.01 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3929  ABC transporter-related protein  37.32 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.992166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2713  ABC transporter related  36.27 
 
 		 510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3688  ABC transporter related  36.65 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3885  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  37.4 
 
 		 507 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0763  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.831413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 		 516 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  37.73 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  37.07 
 
 		 498 aa  296  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  38.8 
 
 		 519 aa  296  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.27 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  37.06 
 
 		 506 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  33.67 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.27 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  34.9 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  38.32 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  33.67 
 
 		 501 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  35.51 
 
 		 523 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  34.87 
 
 		 487 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  37.53 
 
 		 500 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  36.23 
 
 		 507 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 494 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  37.53 
 
 		 499 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  37.53 
 
 		 499 aa  292  8e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  35.19 
 
 		 500 aa  292  9e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  35.19 
 
 		 500 aa  292  9e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 		 506 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 494 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  33.06 
 
 		 496 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  37.58 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  33 
 
 		 496 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  37.68 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4514  ABC transporter related  37.42 
 
 		 498 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0372056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  35.26 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  34.29 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  34.76 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  38.09 
 
 		 498 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000554602  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  35.19 
 
 		 500 aa  291  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  36.73 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.76 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  34.76 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  34.76 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 		 494 aa  290  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  34.76 
 
 		 501 aa  290  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  36.79 
 
 		 499 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  34.29 
 
 		 501 aa  289  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  32.45 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 528 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  34.76 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  34.55 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.66 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  34.51 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  34.67 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  37.27 
 
 		 528 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  33.74 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  37.19 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  34.51 
 
 		 496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  36.93 
 
 		 500 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  34.48 
 
 		 516 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 506 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  34.48 
 
 		 516 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  34.36 
 
 		 500 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  34.48 
 
 		 516 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  34.48 
 
 		 516 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  36.44 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  34.48 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  33.4 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  36.17 
 
 		 544 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 		 541 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  33.54 
 
 		 495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  35.93 
 
 		 517 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  34.15 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  35.34 
 
 		 504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  34.82 
 
 		 511 aa  283  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  36.31 
 
 		 529 aa  282  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  36.23 
 
 		 499 aa  283  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  33.2 
 
 		 502 aa  282  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  36.9 
 
 		 508 aa  282  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  30.69 
 
 		 496 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  35.2 
 
 		 505 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  34.66 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.66 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  34.91 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 519 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  36.02 
 
 		 503 aa  281  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2723  ABC transporter related  35.52 
 
 		 515 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 508 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1593  ABC transporter related  37.91 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>