More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2713 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3343  ABC transporter related  75.72 
 
 		 505 aa  751    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2713  ABC transporter related  100 
 
 		 510 aa  1031    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.31 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0763  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.831413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3929  ABC transporter-related protein  48.27 
 
 		 517 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.992166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3885  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 509 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3688  ABC transporter related  48.07 
 
 		 509 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4514  ABC transporter related  47.45 
 
 		 498 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0372056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  48.07 
 
 		 498 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000554602  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1593  ABC transporter related  45.9 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  39.11 
 
 		 506 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  36.82 
 
 		 504 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  36.79 
 
 		 492 aa  339  5.9999999999999996e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  36.42 
 
 		 503 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  36.22 
 
 		 503 aa  339  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  37.98 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 498 aa  336  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  35.4 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.1 
 
 		 495 aa  335  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  37.13 
 
 		 506 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  38.17 
 
 		 519 aa  333  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  38.59 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  37.7 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.2 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  36.22 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  37.7 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  37.7 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  37.45 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  35.6 
 
 		 499 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  35.6 
 
 		 499 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  37.12 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  36.07 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 		 511 aa  329  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  36.77 
 
 		 512 aa  329  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  37.12 
 
 		 515 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.73 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  37.82 
 
 		 506 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  32.86 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  35.96 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  37.82 
 
 		 506 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  37.04 
 
 		 513 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  36.97 
 
 		 517 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  33.47 
 
 		 501 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  36.35 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  37.62 
 
 		 528 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  36.9 
 
 		 513 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  36.29 
 
 		 520 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  37.92 
 
 		 506 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  37.92 
 
 		 506 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  37.92 
 
 		 506 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 		 507 aa  323  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 		 512 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2443  ABC transporter related  36.84 
 
 		 494 aa  323  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 495 aa  323  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2434  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936114  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  37.27 
 
 		 508 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  35.21 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  35.35 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  35.87 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  37.45 
 
 		 507 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 		 496 aa  321  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  38.76 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  37.47 
 
 		 517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  37.45 
 
 		 507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  36.66 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 528 aa  319  6e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  35.15 
 
 		 496 aa  319  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 494 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  34.82 
 
 		 503 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  34.74 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  33.47 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  35.56 
 
 		 510 aa  318  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  35.21 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.7 
 
 		 514 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  35.38 
 
 		 495 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  35.64 
 
 		 502 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  36.09 
 
 		 513 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  33.93 
 
 		 505 aa  316  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 		 516 aa  316  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  36.27 
 
 		 516 aa  316  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 494 aa  316  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  37.15 
 
 		 497 aa  316  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>