79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0099 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0099  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  100 
 
 
400 aa  806  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0679  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  28.08 
 
 
387 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0588  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  25.55 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0604  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  25.41 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4004  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.55 
 
 
399 aa  70.1  7e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39350  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  26.67 
 
 
319 aa  63.5  6e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1956  monosaccharide-transporting ATPase  27.38 
 
 
318 aa  62  2e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0141518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2133  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.05 
 
 
320 aa  60.5  5e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3346  ribose ABC transporter periplasmic binding protein  24.39 
 
 
337 aa  60.5  6e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2342  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.69 
 
 
378 aa  59.7  8e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1595  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.71 
 
 
368 aa  59.7  9e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.32236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.46 
 
 
320 aa  59.3  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3690  hypothetical protein  23.47 
 
 
366 aa  57.8  3e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3887  hypothetical protein  23.15 
 
 
366 aa  56.6  7e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2454  monosaccharide-transporting ATPase  24.52 
 
 
319 aa  56.2  9e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2019  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  25.44 
 
 
320 aa  55.1  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1853  putative ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  25.44 
 
 
320 aa  55.1  2e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1866  putative ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  25.44 
 
 
376 aa  55.5  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3236  monosaccharide-transporting ATPase  24.52 
 
 
319 aa  55.1  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.271334  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2807  monosaccharide-transporting ATPase  28.02 
 
 
326 aa  55.5  2e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0765  ABC-type sugar-binding periplasmic protein  22.61 
 
 
369 aa  55.1  2e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2475  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  25.09 
 
 
320 aa  54.3  4e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3931  hypothetical protein  22.98 
 
 
366 aa  53.9  5e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.02 
 
 
319 aa  53.5  6e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577745  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0947  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.4 
 
 
319 aa  53.1  7e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103002  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5305  ABC transporter, binding protein  30.2 
 
 
346 aa  53.5  7e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.325241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2367  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  24.66 
 
 
319 aa  53.5  7e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1631  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.2 
 
 
316 aa  51.6  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.817449  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3492  monosaccharide-transporting ATPase  23.58 
 
 
319 aa  51.6  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.324039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3345  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.91 
 
 
373 aa  51.6  2e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2263  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.3 
 
 
320 aa  52.4  2e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4334  Monosaccharide-transporting ATPase  26.24 
 
 
327 aa  52  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.731249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1997  ABC ribose transporter, periplasmic ligand binding protein  26.13 
 
 
320 aa  52  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.57 
 
 
309 aa  51.2  3e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00405542  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  24.62 
 
 
295 aa  51.2  3e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4597  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.52 
 
 
328 aa  50.8  4e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0491755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2475  monosaccharide-transporting ATPase  24.19 
 
 
321 aa  50.8  4e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4745  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.22 
 
 
316 aa  50.1  8e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193376  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1606  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.8 
 
 
316 aa  49.7  8e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.099451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1503  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.8 
 
 
316 aa  50.1  8e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1583  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.8 
 
 
316 aa  49.7  8e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0401008  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.22 
 
 
316 aa  49.7  8e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39428  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1126  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.8 
 
 
316 aa  49.7  8e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.38 
 
 
308 aa  49.7  8e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0934818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.98 
 
 
318 aa  49.7  9e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186495  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5039  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.1 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.1 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.33 
 
 
319 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144836  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1237  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.12 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0190495  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0612  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.92 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0573  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  37.68 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1017  sugar-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.4 
 
 
319 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.353153  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5971  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.34 
 
 
341 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00726122  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4157  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.03 
 
 
321 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.645067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.39 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131793  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1724  twin-arginine translocation pathway signal  35.38 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.63 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.73406e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3087  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.89 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154884  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5319  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.37 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693893  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.28 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2362  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.04 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1721  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.27 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0806  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  27.75 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1961  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.87 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2204  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00482964  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0858  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  38.57 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617839  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2915  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.37 
 
 
315 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2124  Monosaccharide-transporting ATPase  45.76 
 
 
316 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6576  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.51 
 
 
356 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807047  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1256  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.51 
 
 
356 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.307544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1853  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  38.57 
 
 
316 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1963  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.57 
 
 
316 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.074975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3274  putative ABC transporter, periplasmic-binding protein y4mI-like protein  25.47 
 
 
329 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4537  sugar ABC transporter  46.88 
 
 
337 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6181  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.11 
 
 
356 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6851  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.68 
 
 
335 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4112  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  24.75 
 
 
340 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2409  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.1 
 
 
314 aa  43.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2371  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.57 
 
 
341 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>