89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0588 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0588  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  100 
 
 		 390 aa  799    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0604  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  61.89 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4004  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.75 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2342  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.93 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0099  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  24.53 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0679  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  27.27 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1595  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.9 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.32236  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0806  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  25.45 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4516  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  21.64 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02363  signal peptide protein  22.19 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0272231 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0765  ABC-type sugar-binding periplasmic protein  21.5 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1810  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.19 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0233725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3345  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  21.28 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.32 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  24.89 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2362  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.92 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5039  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.04 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.09 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3931  hypothetical protein  22.02 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2711  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  19.37 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4740  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.66 
 
 		 327 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130889 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06143  D-ribose transporter subunit RbsB  25.54 
 
 		 292 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0587  hypothetical protein  32.48 
 
 		 97 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 289 aa  53.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000339  ribose ABC transport system ribose-binding protein RbsB  24.68 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3690  hypothetical protein  20.54 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2109  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.71 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292423  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0419  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.15 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1480  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.65 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1599  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.35 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1369  D-ribose transporter subunit RbsB  24.89 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3887  hypothetical protein  20.54 
 
 		 366 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6409  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  20.98 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000000237151  normal  0.403501 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0008  D-ribose transporter subunit RbsB  24.24 
 
 		 294 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 295 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.03 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000233808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2605  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.03 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1855  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.75 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.89 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0381  Monosaccharide-transporting ATPase  26.29 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.81 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2028  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.31 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4340  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.1 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2801  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.14 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3830  hypothetical protein  22.66 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.985949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04060  hypothetical protein  24.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5745  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4856  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3766  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.56 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4705  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3783  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04096  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4481  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4797  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  24.31 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.74 
 
 		 329 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1681  putative secreted solute-binding lipoprotein  25.74 
 
 		 344 aa  46.2  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156663  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1336  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  24.79 
 
 		 312 aa  46.2  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.454554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1871  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0502  ABC transporter sugar-binding protein  28.71 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.445823  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4067  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.37 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0151386  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1312  ABC transporter substrate-binding protein or LacI-type transcriptional regulator  20.69 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  24.36 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2406  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.51 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362363  normal  0.524454 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4654  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.43 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.995284  normal  0.589042 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1798  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.63 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.39 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0114  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  24.84 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.686148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2127  ABC transporter periplasmic-binding protein ytfQ precursor  31.3 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5185  putative signal peptide protein  19.33 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.0737238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2124  Monosaccharide-transporting ATPase  21.52 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.58 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3770  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.741987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1574  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.37 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1630  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.37 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0517  D-ribose transporter subunit RbsB  23.18 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4347  ribose ABC transporter, substrate binding protein  26.21 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3110  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.39 
 
 		 294 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00370209  hitchhiker  0.000114297 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4759  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.99 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125335  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3975  D-ribose transporter subunit RbsB  27.07 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0740173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3227  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0308005  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4235  D-ribose transporter subunit RbsB  28.1 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000930744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4525  D-ribose transporter subunit RbsB  28.1 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00203677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1399  rhizopine-binding protein precursor  24.17 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000528006  normal  0.827429 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6100  carbohydrate binding protein  23.89 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.31 
 
 		 319 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0970  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.77 
 
 		 318 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>