52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2342 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2342  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 378 aa  771    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2362  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  53.73 
 
 		 380 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0588  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  24.16 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0604  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  24.16 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0806  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  24.63 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0679  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  22.22 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3690  hypothetical protein  23.56 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3887  hypothetical protein  24.01 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3931  hypothetical protein  23.48 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0419  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.11 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0099  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  23.69 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.5 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6223  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.46 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3345  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.77 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2711  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.49 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1810  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.23 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0233725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.16 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5039  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.1 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.9 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4189  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.34 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4516  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  22.29 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2682  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.77 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1312  ABC transporter substrate-binding protein or LacI-type transcriptional regulator  22.39 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4004  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.22 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4157  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.88 
 
 		 321 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.645067 
 
 
-
 
NC_003296  RS02363  signal peptide protein  24.68 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0272231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3274  putative ABC transporter, periplasmic-binding protein y4mI-like protein  26.4 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501296  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0765  ABC-type sugar-binding periplasmic protein  21.83 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0699  ABC transporter substrate-binding protein  27.17 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000602744  hitchhiker  0.00000163268 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6409  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  21.56 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000000237151  normal  0.403501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39350  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  26.79 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  21.77 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1595  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.6 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.32236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2603  twin-arginine translocation pathway signal  23.38 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.912871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.03 
 
 		 318 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3041  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.07 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3001  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.23 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2263  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.81 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0573  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.78 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1126  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.62 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1606  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.62 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.099451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1583  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.62 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0401008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4625  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.98 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.525494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4745  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.62 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193376  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  27.17 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.83 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.83 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1503  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.18 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.18 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1237  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.52 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0190495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  27.98 
 
 		 352 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.23 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>