More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1656 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  100 
 
 
377 aa  783  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.23228e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  57.34 
 
 
411 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  52.57 
 
 
377 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  54.79 
 
 
377 aa  399  1e-110  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  53.63 
 
 
401 aa  400  1e-110  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  54.02 
 
 
377 aa  398  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  51.77 
 
 
381 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  53.19 
 
 
377 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  52.79 
 
 
377 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
376 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  49.73 
 
 
372 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  37.02 
 
 
378 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  34.72 
 
 
379 aa  209  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  32.5 
 
 
379 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  31.49 
 
 
376 aa  193  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  29.02 
 
 
368 aa  179  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  31.94 
 
 
387 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.55 
 
 
393 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  29.97 
 
 
384 aa  147  4e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  27.65 
 
 
381 aa  146  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  31.12 
 
 
394 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  30.31 
 
 
387 aa  141  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.42 
 
 
401 aa  137  3e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  1.72014e-07 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  30.67 
 
 
416 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.61 
 
 
367 aa  135  1e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.53 
 
 
412 aa  132  7e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.53 
 
 
406 aa  132  1e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  6.02764e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.83 
 
 
406 aa  132  1e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  5.7861e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.53 
 
 
406 aa  131  2e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  29.1 
 
 
372 aa  131  2e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  28.53 
 
 
406 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  28.53 
 
 
406 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.53 
 
 
406 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.53 
 
 
406 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  1.07568e-08 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.53 
 
 
406 aa  130  4e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.54851e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.19 
 
 
417 aa  129  7e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.79 
 
 
406 aa  129  8e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  28.69 
 
 
422 aa  129  8e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  26.68 
 
 
389 aa  129  8e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.19 
 
 
406 aa  128  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04018e-08 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  31.18 
 
 
394 aa  128  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.19 
 
 
406 aa  128  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  7.97081e-10 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.06 
 
 
406 aa  127  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  7.37026e-08 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.06 
 
 
406 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.75 
 
 
406 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  25.97 
 
 
391 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.22 
 
 
406 aa  122  1e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  2.89207e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  25.62 
 
 
381 aa  122  1e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25 
 
 
408 aa  122  1e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  28.01 
 
 
392 aa  121  2e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.85 
 
 
417 aa  121  2e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.25 
 
 
393 aa  121  2e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  25.07 
 
 
379 aa  121  2e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  26.27 
 
 
377 aa  120  5e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  27.09 
 
 
398 aa  120  5e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.31 
 
 
879 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.08 
 
 
406 aa  119  1e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  2.83455e-05 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  28.03 
 
 
379 aa  117  2e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  30.84 
 
 
382 aa  118  2e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.19 
 
 
394 aa  117  4e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.45 
 
 
896 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  28.8 
 
 
355 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  29.72 
 
 
287 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.27 
 
 
387 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.53 
 
 
885 aa  116  7e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  29.83 
 
 
427 aa  115  1e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  25.37 
 
 
410 aa  115  1e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.99 
 
 
413 aa  114  2e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.67 
 
 
410 aa  114  2e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  27.11 
 
 
405 aa  114  2e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  26.8 
 
 
404 aa  114  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  29.15 
 
 
427 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.45 
 
 
406 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  27.39 
 
 
399 aa  114  4e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  27.03 
 
 
415 aa  113  4e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.9 
 
 
406 aa  114  4e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.9 
 
 
406 aa  114  4e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  27.63 
 
 
393 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.66 
 
 
878 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  29.3 
 
 
420 aa  112  1e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  27.06 
 
 
410 aa  112  1e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.59 
 
 
418 aa  112  1e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.8 
 
 
406 aa  111  2e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.1207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  27.13 
 
 
381 aa  111  2e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.07 
 
 
374 aa  111  2e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.97 
 
 
418 aa  111  2e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.87 
 
 
428 aa  111  2e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  26 
 
 
421 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  26.44 
 
 
393 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.48 
 
 
413 aa  110  4e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.98 
 
 
413 aa  110  4e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.48 
 
 
413 aa  110  4e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.52 
 
 
414 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  24.15 
 
 
880 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.83 
 
 
417 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl248  selenocysteine lyase, class V pyridoxal phosphate aminotransferase, cysteine desulfurase  26.93 
 
 
408 aa  109  7e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00113755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.1 
 
 
414 aa  109  8e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  27.11 
 
 
403 aa  109  9e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.21 
 
 
644 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  27.72 
 
 
393 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>