More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0044 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  100 
 
 
574 aa  1174  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  48.01 
 
 
584 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  44.99 
 
 
588 aa  516  1e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  47.5 
 
 
584 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  49.19 
 
 
617 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  49.34 
 
 
581 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.2434e-06  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  49.34 
 
 
581 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.61356e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  49.34 
 
 
581 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.92318e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  49.53 
 
 
581 aa  501  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.65097e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  47.41 
 
 
582 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.55759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  47.41 
 
 
582 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.95537e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  49.34 
 
 
581 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  49.34 
 
 
581 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.06976e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  49.34 
 
 
581 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  47.41 
 
 
582 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.22663e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  44.94 
 
 
585 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  46.47 
 
 
584 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  45.73 
 
 
582 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  49.15 
 
 
581 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.4553e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  47.1 
 
 
582 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  44.03 
 
 
586 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  49.15 
 
 
581 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.72934e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  46.94 
 
 
575 aa  493  1e-138  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  46.72 
 
 
581 aa  494  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  46.91 
 
 
584 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  46.86 
 
 
574 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  46.55 
 
 
581 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  46.55 
 
 
581 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  46.55 
 
 
581 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.08195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  46.55 
 
 
581 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  45.94 
 
 
581 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  46.6 
 
 
574 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  47.03 
 
 
574 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  45.99 
 
 
574 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  45.64 
 
 
574 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  45.99 
 
 
575 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  45.82 
 
 
574 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.53498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  46.61 
 
 
577 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  45.99 
 
 
574 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  44.88 
 
 
586 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  44.62 
 
 
638 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  46.5 
 
 
574 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  44.37 
 
 
583 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  46.33 
 
 
601 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  46.79 
 
 
576 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  46.61 
 
 
577 aa  485  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  42.9 
 
 
663 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  45.99 
 
 
574 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.82839e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.35 
 
 
660 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  46.18 
 
 
574 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  54.46 
 
 
656 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  44.14 
 
 
571 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  44.93 
 
 
576 aa  475  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.4448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.19 
 
 
660 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  45.12 
 
 
573 aa  469  1e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  43.22 
 
 
609 aa  470  1e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.33993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  46.71 
 
 
579 aa  466  1e-130  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  43.93 
 
 
578 aa  468  1e-130  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  52.28 
 
 
664 aa  466  1e-130  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  45.77 
 
 
614 aa  465  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  53.85 
 
 
663 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  51.92 
 
 
655 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  42.81 
 
 
584 aa  460  1e-128  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  41.92 
 
 
651 aa  459  1e-128  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  53.36 
 
 
660 aa  459  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  51.69 
 
 
652 aa  459  1e-128  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  53.36 
 
 
660 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  42.44 
 
 
588 aa  455  1e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  43.79 
 
 
577 aa  454  1e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  44.18 
 
 
592 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  42.34 
 
 
595 aa  451  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  42.86 
 
 
553 aa  448  1e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  42.86 
 
 
572 aa  447  1e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  42.91 
 
 
594 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  43.71 
 
 
613 aa  432  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  48.36 
 
 
666 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  48.98 
 
 
576 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.48842e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  43.5 
 
 
565 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  43.91 
 
 
576 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  44.22 
 
 
578 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  50.12 
 
 
631 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  42.55 
 
 
559 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  42.8 
 
 
583 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  46.41 
 
 
676 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  47.42 
 
 
677 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  46.98 
 
 
598 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  41.16 
 
 
603 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  42.06 
 
 
603 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  45.56 
 
 
660 aa  379  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  44.86 
 
 
625 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  45.39 
 
 
645 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  47.18 
 
 
603 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  44.67 
 
 
659 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  42.97 
 
 
653 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  43.81 
 
 
604 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  48.95 
 
 
606 aa  363  4e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  38.42 
 
 
630 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  39.13 
 
 
622 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  38.93 
 
 
800 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  38.93 
 
 
625 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>