More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0144 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  71.92 
 
 
152 aa  199  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.11 
 
 
153 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.96 
 
 
155 aa  161  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  57.85 
 
 
156 aa  157  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  53.91 
 
 
151 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  49.22 
 
 
151 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.97 
 
 
163 aa  146  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.62 
 
 
157 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.53 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.8 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.15 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  42.96 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.77 
 
 
153 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.18 
 
 
153 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
160 aa  120  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.18 
 
 
153 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.9 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.6 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.16 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.83 
 
 
155 aa  110  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.19 
 
 
223 aa  110  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.75 
 
 
155 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.75 
 
 
161 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.1 
 
 
158 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.91 
 
 
158 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  38.06 
 
 
163 aa  103  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  37.98 
 
 
157 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  40 
 
 
149 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.44 
 
 
183 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.81 
 
 
164 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36.84 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 
160 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.31 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  35.07 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.07 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.55 
 
 
164 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  34.85 
 
 
154 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  34.85 
 
 
154 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.16 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.53 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.69 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  43.36 
 
 
186 aa  90.1  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  45.6 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  35.4 
 
 
167 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.97 
 
 
157 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  35.51 
 
 
155 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.01 
 
 
190 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.79 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.27 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  42.03 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  32.09 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.61 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.81 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.86 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  31.82 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  37.19 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  37.19 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 
176 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.86 
 
 
211 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.27 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.7 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  41.46 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.7 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.62 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.64 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  34.15 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.3 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.95 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.85 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.42 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.42 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  37.84 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.58 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.74 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  35.83 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  35.42 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  33.61 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.65 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.62 
 
 
524 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  34.78 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.62 
 
 
484 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.24 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.8 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.84 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.58 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  39.33 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.73 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.08 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35 
 
 
189 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00940  cytosine/adenosine deaminase  31.06 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  37.37 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  36.46 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0003  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.33 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4585  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.16 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.639578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>