274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0091 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  100 
 
 
253 aa  494  1e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.95 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.95 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  9.32687e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 
250 aa  83.2  4e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.15 
 
 
255 aa  82  7e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.39 
 
 
253 aa  81.3  2e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.87 
 
 
253 aa  79.3  5e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 
255 aa  79  7e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.18 
 
 
253 aa  76.6  4e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.76 
 
 
253 aa  75.5  8e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 
290 aa  73.9  2e-12  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.91 
 
 
261 aa  72.8  4e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 
254 aa  73.2  4e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
278 aa  72.4  6e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 
278 aa  72.4  6e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 
253 aa  69.3  6e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
285 aa  68.6  1e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.47 
 
 
251 aa  67.8  1e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 
289 aa  67.8  1e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
256 aa  66.6  4e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 
263 aa  66.2  5e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25.73 
 
 
284 aa  65.9  5e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.17 
 
 
254 aa  64.7  1e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 
251 aa  64.7  1e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.16 
 
 
249 aa  64.7  1e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.07 
 
 
264 aa  64.3  2e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 
260 aa  64.3  2e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  5.66487e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  24.07 
 
 
264 aa  63.9  2e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 
254 aa  64.3  2e-09  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  24.02 
 
 
268 aa  62.8  5e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 
304 aa  62.8  5e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.27 
 
 
249 aa  62.4  7e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  26.05 
 
 
285 aa  62  8e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 
278 aa  61.6  1e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  25.93 
 
 
278 aa  60.8  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 
270 aa  60.8  2e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
241 aa  60.5  3e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 
288 aa  60.1  3e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.94 
 
 
249 aa  60.1  3e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 
270 aa  59.7  4e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.45 
 
 
249 aa  59.3  6e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 
280 aa  59.3  6e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16393e-06 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  26.67 
 
 
275 aa  58.2  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 
278 aa  57.8  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  25.82 
 
 
278 aa  57.8  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  25.82 
 
 
278 aa  57.8  1e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 
278 aa  57.8  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 
278 aa  57.8  1e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.67 
 
 
275 aa  58.5  1e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 
272 aa  58.5  1e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 
278 aa  57.8  1e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 
278 aa  57.8  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.73 
 
 
249 aa  57.8  2e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 
260 aa  57  3e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
281 aa  57  3e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.55 
 
 
263 aa  56.6  4e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  25.43 
 
 
289 aa  56.6  4e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  25.7 
 
 
262 aa  56.6  4e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 
270 aa  55.8  6e-07  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 
257 aa  55.8  6e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 
289 aa  55.8  6e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  24.88 
 
 
262 aa  55.5  8e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  23.88 
 
 
276 aa  55.1  1e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 
280 aa  55.1  1e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  24.03 
 
 
284 aa  54.7  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
256 aa  54.7  1e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  26.22 
 
 
275 aa  55.1  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 
277 aa  55.1  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
248 aa  53.9  2e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 
264 aa  54.3  2e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  26.97 
 
 
276 aa  54.3  2e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3849  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
252 aa  53.5  3e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.33 
 
 
261 aa  53.5  3e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.33601e-06  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 
252 aa  53.5  3e-06  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 
290 aa  53.5  3e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  29.32 
 
 
246 aa  53.5  3e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  23.14 
 
 
281 aa  53.9  3e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 
270 aa  53.5  3e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  24.68 
 
 
273 aa  53.1  4e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  22.67 
 
 
269 aa  53.1  4e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  22.67 
 
 
269 aa  53.1  4e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  24.21 
 
 
254 aa  52.8  6e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 
242 aa  52.4  7e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  25 
 
 
277 aa  52  8e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
256 aa  52.4  8e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 
253 aa  52  9e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
375 aa  51.6  1e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  26 
 
 
277 aa  51.2  1e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  27.65 
 
 
251 aa  51.2  1e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 
257 aa  51.6  1e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 
270 aa  51.6  1e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.62 
 
 
356 aa  52  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 
251 aa  52  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 
261 aa  51.6  1e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 
269 aa  52  1e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  23.3 
 
 
280 aa  51.2  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  25 
 
 
277 aa  50.8  2e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  25.14 
 
 
274 aa  51.2  2e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  26 
 
 
277 aa  51.2  2e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  25 
 
 
277 aa  51.2  2e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>