More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2959 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  75.73 
 
 
421 aa  651  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  7.71215e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 
433 aa  876  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  80.77 
 
 
424 aa  692  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  74.82 
 
 
429 aa  643  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  71.5 
 
 
443 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  73.75 
 
 
425 aa  612  1e-174  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  69.06 
 
 
435 aa  591  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.01 
 
 
426 aa  567  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.78 
 
 
421 aa  564  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.08 
 
 
441 aa  564  1e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.18 
 
 
435 aa  554  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.64 
 
 
442 aa  549  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.44 
 
 
417 aa  538  1e-152  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.44 
 
 
417 aa  538  1e-152  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.92 
 
 
417 aa  540  1e-152  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  61.76 
 
 
421 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.22 
 
 
442 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.15 
 
 
449 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  62.88 
 
 
417 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.41 
 
 
419 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.65 
 
 
434 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  63.08 
 
 
441 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  63.4 
 
 
425 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.39 
 
 
419 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  59.62 
 
 
429 aa  516  1e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.7 
 
 
411 aa  517  1e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.17 
 
 
434 aa  517  1e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.74 
 
 
415 aa  517  1e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.86 
 
 
418 aa  516  1e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.77 
 
 
443 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.86 
 
 
441 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.71182e-10 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.61 
 
 
432 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.94 
 
 
446 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.74 
 
 
428 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  60.28 
 
 
435 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.53 
 
 
412 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.69 
 
 
435 aa  454  1e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  54.99 
 
 
414 aa  450  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.48 
 
 
414 aa  446  1e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.55 
 
 
414 aa  447  1e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.4 
 
 
412 aa  439  1e-122  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.33 
 
 
429 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.81 
 
 
429 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.56 
 
 
414 aa  435  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.74 
 
 
417 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.09 
 
 
429 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  55.42 
 
 
408 aa  430  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  49.64 
 
 
413 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.92 
 
 
406 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.68 
 
 
413 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.68 
 
 
413 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.07 
 
 
415 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
406 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.7 
 
 
451 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.64 
 
 
425 aa  422  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
414 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 
414 aa  416  1e-115  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  53 
 
 
414 aa  416  1e-115  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.24 
 
 
409 aa  418  1e-115  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.57 
 
 
414 aa  417  1e-115  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.28 
 
 
408 aa  417  1e-115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.04 
 
 
410 aa  417  1e-115  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  51.05 
 
 
422 aa  417  1e-115  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
412 aa  417  1e-115  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  46.65 
 
 
406 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  47.13 
 
 
406 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  47.13 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  46.65 
 
 
406 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.39 
 
 
406 aa  411  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  47.13 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  48.06 
 
 
434 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  47.13 
 
 
406 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  46.65 
 
 
406 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.89 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  47.13 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.61 
 
 
420 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.29 
 
 
429 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.4 
 
 
406 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  46.65 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.79 
 
 
425 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.96 
 
 
419 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  46.65 
 
 
423 aa  408  1e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  47.73 
 
 
410 aa  405  1e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
413 aa  405  1e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.84 
 
 
427 aa  406  1e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  47.69 
 
 
417 aa  406  1e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.65 
 
 
420 aa  405  1e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  2.91669e-06 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.67 
 
 
404 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  48.23 
 
 
424 aa  403  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.39 
 
 
409 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  46.38 
 
 
420 aa  401  1e-110  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
414 aa  401  1e-110  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  45.32 
 
 
420 aa  400  1e-110  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  49.76 
 
 
416 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  45.85 
 
 
428 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  47.33 
 
 
426 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.54 
 
 
406 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.87 
 
 
416 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  48.56 
 
 
405 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  48.67 
 
 
496 aa  395  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>