More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2838 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  100 
 
 
264 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
262 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
263 aa  156  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
263 aa  156  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
263 aa  156  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  37.39 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
263 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.38 
 
 
263 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  34.6 
 
 
258 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  35.52 
 
 
258 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  30.64 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.96 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  24.71 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  24.31 
 
 
266 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.12 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  32.77 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.33 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.76 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  32.92 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.52 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.52 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.52 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  28.52 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  34.35 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  25.59 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  33.59 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.09 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  48.04 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.14 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.63 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.83 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.88 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.38 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.88 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.8 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.17 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  30.89 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.14 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.95 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  41 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  27 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.29 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  34.62 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  31.58 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.58 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.08 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  33.6 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.58 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2134  hypothetical protein  31.58 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.33 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.3 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.12 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  27 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2109  hypothetical protein  31.58 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.96 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  37.18 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  30.89 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  31.3 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  27.33 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.78 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.06 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  38.4 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.7 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.2 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.34 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  37.61 
 
 
307 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.16 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.6 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>