249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2826 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  100 
 
 
461 aa  902    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  59.8 
 
 
403 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  54.09 
 
 
425 aa  411  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  58.29 
 
 
418 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  52.25 
 
 
413 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  53.3 
 
 
414 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  50.36 
 
 
413 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  50.36 
 
 
413 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  49.76 
 
 
436 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  49.88 
 
 
419 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  49.76 
 
 
420 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  50.12 
 
 
413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  46.81 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  50.24 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  48.77 
 
 
419 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  45.87 
 
 
411 aa  329  7e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  49.04 
 
 
412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  48.05 
 
 
416 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  46.19 
 
 
417 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  46.8 
 
 
411 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  50.53 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  44.36 
 
 
411 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  48.47 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  44.99 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  45.66 
 
 
411 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  43.42 
 
 
443 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  46.15 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 
445 aa  276  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  43.03 
 
 
428 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  39.22 
 
 
412 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  41.86 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  38.96 
 
 
412 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  40.81 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  47.01 
 
 
393 aa  262  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  41.81 
 
 
425 aa  259  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  39.18 
 
 
406 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.95 
 
 
456 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.69 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  32.55 
 
 
478 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  37.09 
 
 
447 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  33.18 
 
 
420 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  33.33 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  35.21 
 
 
486 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.68 
 
 
451 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  32.2 
 
 
421 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  35.11 
 
 
426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  34.54 
 
 
482 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  35.36 
 
 
461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  34.61 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.35 
 
 
407 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  31.67 
 
 
490 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32.89 
 
 
470 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  31.51 
 
 
436 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.38 
 
 
407 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  30.79 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  32.42 
 
 
434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.57 
 
 
434 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.62 
 
 
413 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.8 
 
 
444 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.33 
 
 
440 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.41 
 
 
444 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  33.75 
 
 
437 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  35.22 
 
 
433 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  32.44 
 
 
419 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.61 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.13 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  34.81 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  33.06 
 
 
405 aa  163  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  30.48 
 
 
444 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.14 
 
 
447 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  34.1 
 
 
428 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  35.52 
 
 
459 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  32.64 
 
 
433 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.83 
 
 
412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  30.62 
 
 
430 aa  156  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  31.38 
 
 
429 aa  156  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  32.41 
 
 
421 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.93 
 
 
433 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.4 
 
 
426 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.05 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.84 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.41 
 
 
432 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  28.31 
 
 
447 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  35.32 
 
 
419 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.54 
 
 
423 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.26 
 
 
421 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.41 
 
 
409 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.58 
 
 
408 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  34.5 
 
 
415 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.41 
 
 
409 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.58 
 
 
408 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.42 
 
 
409 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.58 
 
 
408 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.02 
 
 
417 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.75 
 
 
431 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.02 
 
 
417 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.02 
 
 
417 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33.5 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.63 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  30.54 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>