258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1391 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
204 aa  406  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  42.56 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.92 
 
 
201 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.04 
 
 
197 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.05 
 
 
204 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.56 
 
 
204 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.1 
 
 
212 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
204 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  40.84 
 
 
198 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.23 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 
213 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  42.93 
 
 
221 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  47.2 
 
 
201 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.33 
 
 
210 aa  131  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  40.62 
 
 
218 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  41.58 
 
 
208 aa  130  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.31 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  39.27 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.84 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.22 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.09 
 
 
221 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
217 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.56 
 
 
204 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.01 
 
 
201 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  35.44 
 
 
228 aa  121  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.66 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.67 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.21 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.03 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  40.93 
 
 
205 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  37.85 
 
 
219 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  39.09 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.09 
 
 
217 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  44.09 
 
 
217 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  44.09 
 
 
217 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.11 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  39.58 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  44.36 
 
 
183 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  40.86 
 
 
205 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
208 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
214 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.25 
 
 
209 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.53 
 
 
181 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 
183 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.16 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.79 
 
 
181 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.93 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.11 
 
 
183 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.88 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  32.46 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  39.29 
 
 
199 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.02 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.23 
 
 
178 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 
192 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.15 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
187 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.82 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.75 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.79 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
187 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.05 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.05 
 
 
180 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.5 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.58 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  43.52 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.5 
 
 
199 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.42 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.55 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  36.5 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  35.03 
 
 
179 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
189 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.81 
 
 
183 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.45 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  35.51 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.22 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.34 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  35.46 
 
 
178 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.57 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  35 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  45.37 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>