More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0811 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  52.82 
 
 
158 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  52.11 
 
 
158 aa  159  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
157 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  52.82 
 
 
160 aa  158  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
157 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
157 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
157 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
158 aa  156  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
155 aa  156  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  49.65 
 
 
157 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  50 
 
 
159 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  50.71 
 
 
150 aa  154  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
159 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  50.71 
 
 
150 aa  154  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  49.65 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  49.65 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
160 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  50 
 
 
161 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  47.89 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
158 aa  150  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
165 aa  150  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  47.14 
 
 
156 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  49.31 
 
 
150 aa  148  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  50.72 
 
 
152 aa  147  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  48.59 
 
 
165 aa  147  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
158 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  50 
 
 
159 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  47.55 
 
 
155 aa  146  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  47.06 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  49.29 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  51.91 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  47.89 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  48.63 
 
 
154 aa  144  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  51.75 
 
 
149 aa  144  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
157 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
155 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
159 aa  143  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
165 aa  143  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
153 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.89 
 
 
155 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  48.59 
 
 
161 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  47.89 
 
 
152 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  47.14 
 
 
147 aa  141  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
159 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
155 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
155 aa  140  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  47.55 
 
 
160 aa  140  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
158 aa  140  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
155 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
155 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
150 aa  140  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.59 
 
 
159 aa  140  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
155 aa  140  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
155 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  48.57 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.59 
 
 
153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  45.07 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  45.89 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
155 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
155 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
155 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
155 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
155 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  47.55 
 
 
151 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
158 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  46.85 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  44.37 
 
 
158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  46.81 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  45.99 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  46.81 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  45.07 
 
 
160 aa  136  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  46.58 
 
 
155 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  46.72 
 
 
156 aa  137  7e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  46.76 
 
 
152 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  43.66 
 
 
157 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
150 aa  135  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
154 aa  135  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  43.66 
 
 
157 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
162 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  46.81 
 
 
157 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  47.76 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  45.07 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  44.76 
 
 
157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.48 
 
 
162 aa  134  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  42.96 
 
 
155 aa  134  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.52 
 
 
151 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  44.44 
 
 
155 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  44.44 
 
 
155 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  45.99 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  43.26 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>