More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0543 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  714    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  32.31 
 
 
358 aa  179  8e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
356 aa  161  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  30.79 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 
436 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.73 
 
 
561 aa  76.3  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.73 
 
 
561 aa  76.3  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  38.54 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  30.06 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  29.48 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  24.9 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  37.5 
 
 
577 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  27.98 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  36.73 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
444 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
209 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  36.73 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  36.27 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  24.55 
 
 
308 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.79 
 
 
257 aa  59.3  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  33.96 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.97 
 
 
268 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.41 
 
 
213 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  26.8 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  33.96 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.11 
 
 
1291 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.69 
 
 
260 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  37.14 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  24.83 
 
 
238 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 
203 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  26.58 
 
 
456 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
311 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  31.48 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  27.12 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  24.83 
 
 
235 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  36.19 
 
 
330 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.4 
 
 
238 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 
240 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  36.36 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  34.95 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  34.95 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  34.95 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  34.95 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  34.95 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
2490 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.46 
 
 
259 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.71 
 
 
229 aa  53.9  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.68 
 
 
252 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.17 
 
 
235 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  37.38 
 
 
238 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  37.38 
 
 
238 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 
252 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.69 
 
 
236 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.09 
 
 
220 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.09 
 
 
220 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.09 
 
 
220 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.09 
 
 
220 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.09 
 
 
220 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.09 
 
 
220 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 
252 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.09 
 
 
220 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.37 
 
 
220 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  39.74 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.5 
 
 
271 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.01 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  28.66 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.81 
 
 
269 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.81 
 
 
269 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  26.85 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.09 
 
 
260 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.62 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 
252 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 
252 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  30.69 
 
 
252 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
195 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.72 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
243 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
225 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 
243 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 
252 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  37 
 
 
249 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.28 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
269 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  30.69 
 
 
417 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
234 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.03 
 
 
244 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.05 
 
 
271 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.33 
 
 
237 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>