More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5829 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
338 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  84.34 
 
 
346 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  46.86 
 
 
322 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  46.92 
 
 
387 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.84 
 
 
338 aa  252  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  41.16 
 
 
329 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  45.03 
 
 
338 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  44.79 
 
 
341 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 
321 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  43.25 
 
 
334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
348 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  43.11 
 
 
331 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 
325 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  46.39 
 
 
330 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 
321 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 
321 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  42.73 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
321 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
321 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  41.27 
 
 
338 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 
346 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 
346 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
322 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
321 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 
346 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 
343 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  47.42 
 
 
369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  47.42 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 
369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  43.07 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  42.64 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
324 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
357 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
324 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
324 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  41.36 
 
 
338 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  41.87 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  41.87 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  41.87 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 
327 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  39.12 
 
 
336 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 
336 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  40.72 
 
 
338 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  41.47 
 
 
334 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  40.59 
 
 
334 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  43.41 
 
 
338 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  41.37 
 
 
327 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
322 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  40 
 
 
335 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  42.77 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  38.81 
 
 
362 aa  222  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
319 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  44.88 
 
 
320 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 
317 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  44.25 
 
 
323 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 
311 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 
311 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  41.14 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  45.15 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.14 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.14 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  41.96 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  39.94 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  38.17 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  39.18 
 
 
341 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 
344 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 
344 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  38.55 
 
 
319 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
326 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 
344 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 
344 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  38.08 
 
 
319 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  38.86 
 
 
319 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4813  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 
325 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0342905  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 
358 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
322 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.73 
 
 
349 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 
330 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 
327 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 
327 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 
356 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  40.12 
 
 
342 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  35.87 
 
 
316 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  42.35 
 
 
340 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 
336 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 
351 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.82 
 
 
321 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 
321 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 
321 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 
321 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.82 
 
 
321 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 
321 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
324 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  34.65 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>