99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5188 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  78.38 
 
 
532 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  69.65 
 
 
582 aa  715    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  62.12 
 
 
514 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  82.31 
 
 
593 aa  927    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  81.63 
 
 
601 aa  906    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  77.55 
 
 
571 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1174    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  74.15 
 
 
601 aa  788    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  60.92 
 
 
508 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  60.92 
 
 
508 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  60.07 
 
 
508 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  64.07 
 
 
491 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  60.07 
 
 
508 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  63.88 
 
 
491 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  63.88 
 
 
491 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  61.09 
 
 
516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  54.16 
 
 
506 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  43.82 
 
 
550 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  38.46 
 
 
581 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  38.46 
 
 
581 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  37.94 
 
 
578 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  37.94 
 
 
578 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  38.38 
 
 
593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  38.38 
 
 
593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  38.44 
 
 
620 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  37.3 
 
 
517 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  36.89 
 
 
550 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  36.35 
 
 
524 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  37.27 
 
 
539 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  34.83 
 
 
519 aa  256  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  38.16 
 
 
516 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  54.81 
 
 
519 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  48.68 
 
 
546 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  47.86 
 
 
535 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  57.59 
 
 
511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  57.59 
 
 
488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  46.48 
 
 
480 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  45.41 
 
 
480 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  45.41 
 
 
480 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  35.36 
 
 
578 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  35.36 
 
 
578 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  47.37 
 
 
441 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  47.88 
 
 
473 aa  144  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  44.25 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  36.59 
 
 
512 aa  135  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  53.4 
 
 
484 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  53.4 
 
 
567 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  26.55 
 
 
579 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  27.2 
 
 
475 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  28.18 
 
 
618 aa  88.6  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  51.61 
 
 
565 aa  86.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  51.61 
 
 
620 aa  86.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  40.46 
 
 
743 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  46.88 
 
 
637 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  47.19 
 
 
748 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  46 
 
 
635 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  44.09 
 
 
709 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  38.56 
 
 
198 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  43.27 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3701  hypothetical protein  49.24 
 
 
129 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  29.03 
 
 
519 aa  72  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  40.48 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  43.62 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  44.68 
 
 
122 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  37.17 
 
 
566 aa  63.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  29.71 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  36.96 
 
 
567 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  30.36 
 
 
586 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  38.04 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  33.06 
 
 
510 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  47.62 
 
 
117 aa  58.9  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  24.29 
 
 
557 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  33.7 
 
 
426 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  37.08 
 
 
427 aa  57.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.62 
 
 
628 aa  57.4  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  40.45 
 
 
516 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  36.96 
 
 
443 aa  57  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  35.9 
 
 
602 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.68 
 
 
530 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  40.22 
 
 
714 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  29.81 
 
 
554 aa  54.3  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  37.36 
 
 
605 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  36.36 
 
 
499 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  36.11 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  32.99 
 
 
553 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  38.71 
 
 
535 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  37.1 
 
 
580 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  38.71 
 
 
580 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  25 
 
 
602 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  38.71 
 
 
584 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  37.1 
 
 
558 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  30.28 
 
 
572 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  38.67 
 
 
603 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3573  hypothetical protein  40.54 
 
 
563 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  37.65 
 
 
512 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  32.56 
 
 
620 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  45.1 
 
 
496 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.71 
 
 
566 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  37.5 
 
 
441 aa  43.9  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>