292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2298 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  100 
 
 		 279 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  59.07 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  53.85 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  57.67 
 
 		 286 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  54.3 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  55.72 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  47.39 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  47.68 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  58.2 
 
 		 201 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  59.78 
 
 		 251 aa  195  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  59.78 
 
 		 251 aa  195  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  57.38 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  48.32 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  56.38 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  55.03 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  51.55 
 
 		 201 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  48.13 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  51.53 
 
 		 201 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  54.29 
 
 		 204 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  52.22 
 
 		 205 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  51.3 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  46.8 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  48.94 
 
 		 224 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  43.63 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  46.37 
 
 		 206 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  47.46 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  45.41 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  47.46 
 
 		 204 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  43.6 
 
 		 207 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  42.63 
 
 		 194 aa  138  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  43.5 
 
 		 196 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  45.36 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  46.43 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  44.38 
 
 		 201 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  41.62 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  43.75 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  41.48 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  38.12 
 
 		 199 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  41.72 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.26 
 
 		 151 aa  99  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.67 
 
 		 176 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  32.89 
 
 		 153 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  33.75 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  37.84 
 
 		 154 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  35.81 
 
 		 140 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  33.79 
 
 		 169 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  33.55 
 
 		 150 aa  85.9  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  85.9  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  33.79 
 
 		 169 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  33.79 
 
 		 169 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  35.43 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  42.45 
 
 		 171 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  33.79 
 
 		 152 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  36.18 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  41.18 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  35.14 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  35.62 
 
 		 161 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  35.14 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  35.14 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  35.14 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  35.14 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.14 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  34.64 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  33.61 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  38.32 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  33.75 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  34.42 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  34.46 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  33.61 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  33.78 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  32.65 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  36.94 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  37.38 
 
 		 173 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  36.94 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  35.53 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  36.28 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>