278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2030 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  326  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2033  hypothetical protein  93.21 
 
 
162 aa  308  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  79.63 
 
 
162 aa  269  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  79.01 
 
 
162 aa  269  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  77.78 
 
 
162 aa  263  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  64.97 
 
 
152 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  64.33 
 
 
152 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  64.33 
 
 
152 aa  208  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  64.33 
 
 
152 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  64.33 
 
 
152 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  64.33 
 
 
152 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  63.69 
 
 
152 aa  204  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  63.29 
 
 
153 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  62.66 
 
 
153 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  62.66 
 
 
153 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  62.66 
 
 
153 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  62.66 
 
 
153 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  62.66 
 
 
153 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  62.66 
 
 
153 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  62.66 
 
 
153 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  63.69 
 
 
152 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  63.06 
 
 
152 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  63.06 
 
 
152 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1923  hypothetical protein  51.18 
 
 
177 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1699  hypothetical protein  48.5 
 
 
183 aa  156  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264433 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1095  hypothetical protein  52.47 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1229  hypothetical protein  51.85 
 
 
163 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0921139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  53.69 
 
 
142 aa  147  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  53.47 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  51.95 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2424  hypothetical protein  44.44 
 
 
200 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000350737  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2013  hypothetical protein  44.04 
 
 
202 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000868215  normal  0.600676 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  47.92 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2132  hypothetical protein  37.5 
 
 
204 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  39.29 
 
 
212 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3385  hypothetical protein  40.91 
 
 
202 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214146  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  39.27 
 
 
192 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  40.41 
 
 
197 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  39.38 
 
 
219 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  44.37 
 
 
176 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  39.87 
 
 
151 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  38.31 
 
 
153 aa  100  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  41.06 
 
 
191 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  40.13 
 
 
151 aa  98.2  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  40.4 
 
 
154 aa  97.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  40.4 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  42.21 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  41.06 
 
 
154 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  41.06 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  41.06 
 
 
154 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  41.06 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  41.06 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  40.4 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  40.4 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  40.4 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  40.79 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  40.4 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  40.4 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  36.42 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  40.4 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  40.4 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  40.13 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  40.4 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  36.24 
 
 
238 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  39.74 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  39.74 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  40.54 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  38.71 
 
 
153 aa  94.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  49.09 
 
 
145 aa  94  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  40.54 
 
 
140 aa  94  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  40.54 
 
 
140 aa  94  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  39.07 
 
 
150 aa  94  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  34.36 
 
 
201 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.31 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  38.06 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2751  hypothetical protein  37.71 
 
 
295 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891527  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  42.76 
 
 
158 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  37.42 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  37.42 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  38.85 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.75 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.75 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.75 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  40 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  38.85 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  37.66 
 
 
286 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  36.91 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.9 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  35.33 
 
 
257 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  39.84 
 
 
206 aa  88.2  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  39.85 
 
 
151 aa  87.8  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  34 
 
 
168 aa  87.8  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  36.77 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  31.33 
 
 
251 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  31.33 
 
 
251 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  35.62 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  44.74 
 
 
152 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>