More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2092 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
162 aa  337  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  62.82 
 
 
167 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  62.82 
 
 
167 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  62.18 
 
 
164 aa  206  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  59.62 
 
 
161 aa  198  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  62.76 
 
 
171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  63.45 
 
 
188 aa  195  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  57.76 
 
 
169 aa  194  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  59.62 
 
 
161 aa  193  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  57.05 
 
 
160 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  56.25 
 
 
162 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  64.83 
 
 
166 aa  191  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  64.83 
 
 
166 aa  191  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  56.69 
 
 
188 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 
163 aa  190  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  62.76 
 
 
187 aa  191  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 
178 aa  190  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  64.14 
 
 
168 aa  190  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  59.48 
 
 
167 aa  190  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  58.44 
 
 
167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  55.84 
 
 
168 aa  184  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  62.22 
 
 
180 aa  184  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  56.58 
 
 
168 aa  181  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  60.56 
 
 
180 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  58.11 
 
 
173 aa  177  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  58.55 
 
 
161 aa  176  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  61.31 
 
 
146 aa  176  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  59.06 
 
 
161 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  58.22 
 
 
166 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  58.39 
 
 
178 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  57.89 
 
 
161 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  57.53 
 
 
166 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  55.56 
 
 
153 aa  173  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  59.56 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  59.56 
 
 
161 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  61.83 
 
 
161 aa  167  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  60.61 
 
 
161 aa  163  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  60.29 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  60.29 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  59.21 
 
 
162 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  60.74 
 
 
179 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  58.82 
 
 
176 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 
187 aa  142  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  47.26 
 
 
180 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  53.62 
 
 
185 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  50.34 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 
182 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  47.02 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 
169 aa  131  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  43.51 
 
 
189 aa  130  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  47.83 
 
 
187 aa  128  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
155 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  48.39 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  45.67 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  43.41 
 
 
175 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  37.69 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  36.88 
 
 
161 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 
248 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 
161 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  36.25 
 
 
166 aa  103  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  39.33 
 
 
170 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
162 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.08 
 
 
159 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.48 
 
 
159 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 
159 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
159 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
159 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
159 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  44.8 
 
 
176 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
169 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
158 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.19 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  33.33 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  38.97 
 
 
327 aa  99.8  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
159 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
159 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
159 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
159 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 
170 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 
176 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  36.76 
 
 
163 aa  97.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  39.84 
 
 
168 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  34.84 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  33.75 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  36.99 
 
 
170 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.99 
 
 
170 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.99 
 
 
170 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  36.99 
 
 
170 aa  94.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  36.99 
 
 
170 aa  94  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.99 
 
 
170 aa  94  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  36.36 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.3 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
149 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  35.62 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.4 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.981249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>