More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1899 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
169 aa  348  2e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.88 
 
 
167 aa  246  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  52.38 
 
 
156 aa  162  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  36.05 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  36.67 
 
 
155 aa  111  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  36.99 
 
 
156 aa  111  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  34.93 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.02 
 
 
166 aa  104  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.25 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  33.86 
 
 
135 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.08 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.43 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.14 
 
 
222 aa  79  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.64 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000516884 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.78 
 
 
132 aa  77  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  38.26 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  32.41 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.7 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  34.31 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  34.35 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  36.7 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  36.7 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  37.39 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  32.64 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  32.64 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.73 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  37.1 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.89 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  38.6 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  30.47 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  31.34 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.2 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  35.29 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  31.25 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.06 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.73 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  34.31 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.64 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.56 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  33.91 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  31.85 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  35.59 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.84 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  40 
 
 
615 aa  71.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.94 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.04 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.89 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  37.1 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  34.58 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.88 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.6 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.33 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  27.91 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  38.53 
 
 
616 aa  71.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0146  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.62 
 
 
204 aa  70.9  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00110619  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  30.6 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1437  NADH dehydrogenase subunit I  35.85 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.31 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>